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生物信息学与 AI 制药工程
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037-临床生信报告批次质控
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《ACMG变异解读跨批次证据差异审计》
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本课程属于:037-临床生信报告批次质控
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ACMG变异解读跨批次证据差异审计
共计 30 章节
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01
ACMG变异解读标准概述
发展历程与核心原则
ACMG
变异解读标准概述
02
批次间校验的概念与重要性
批次间校验的概念与重要性 · 核心概念 · 实践要点
批次间校验的概念
重要性
03
变异解读结果的数据结构
变异解读结果的数据结构 · 核心概念 · 实践要点
变异解读结果的数…
重点
04
常见变异数据库介绍(ClinVar、HGMD等)
常见变异数据库介绍(ClinVar · 核心概念 · 实践要点
ClinVar
HGMD
05
变异解读的自动化工具与流程
变异解读的自动化工具与流程 · 核心概念 · 实践要点
变异解读的自动化…
流程
06
批次间一致性评估指标
批次间一致性评估指标 · 核心概念 · 实践要点
批次间一致性评估…
重点
07
变异分类的五大类(致病、可能致病、意义不明确、可能良性、良性)
变异分类的五大类(致病 · 核心概念 · 实践要点
变异分类的五大类
致病
08
证据权重与评分系统
证据权重与评分系统 · 核心概念 · 实践要点
证据权重
评分系统
09
PVS1、PS1等致病性证据的批次间一致性
PVS1 · 核心概念 · 实践要点
PVS1
PS1
10
PM2、BA1等频率证据的批次间一致性
PM2、BA1等频率证据的批次间一致性 · 核心概念 · 实践要点
PM2
BA1
11
PP3、BP4等计算预测证据的批次间一致性
PP3 · 核心概念 · 实践要点
PP3
BP4
12
功能实验证据(PS3/BS3)在批次间的记录差异
功能实验证据(PS3/BS3)在批次间的… · 核心概念 · 实践要点
PS3/BS3
功能实验证据
13
家系共分离证据的一致性校验
家系共分离证据的一致性校验 · 核心概念 · 实践要点
家系共分离证据的…
重点
14
变异解读报告模板与字段标准
变异解读报告模板与字段标准 · 核心概念 · 实践要点
变异解读报告模板
字段标准
15
不同批次间解读人员的判读差异分析
不同批次间解读人员的判读差异分析 · 核心概念 · 实践要点
不同批次间解读人…
重点
16
人工审核流程中的校验点
人工审核流程中的校验点 · 核心概念 · 实践要点
人工审核流程
校验点
17
编写校验脚本
Python读取变异解读表格
编写校验脚本
Python
18
常用Python库
pandas · openpyxl用于数据处理
Python
常用
19
比较两个批次解读结果
字段匹配与差异检测
比较两个批次解读…
字段匹配
20
变异分类一致性的统计方法(Kappa系数等)
变异分类一致性的统计方法(Kappa系数… · 核心概念 · 实践要点
Kappa
变异分类一致性的…
21
证据级别变化的追踪与记录
证据级别变化的追踪与记录 · 核心概念 · 实践要点
证据级别变化的追…
记录
22
批次间新增变异的处理策略
批次间新增变异的处理策略 · 核心概念 · 实践要点
批次间新增变异的…
重点
23
批次间删除/废弃变异的处理策略
批次间删除/废弃变异的处理策略 · 核心概念 · 实践要点
批次间删除
废弃变异的处理策…
24
变异ID(如RS号、chr
pos)在不同版本的比对
ID
RS
25
版本控制与数据溯源
版本控制与数据溯源 · 核心概念 · 实践要点
版本控制
数据溯源
26
实操案例1
两个批次解读结果的差异分析
实操案例1
两个批次解读结果…
27
实操案例2
自动化校验脚本的编写与调试
实操案例2
自动化校验脚本的…
28
实操案例3
生成差异报告与可视化(matplot…
实操案例3
matplot
29
常见问题与避坑指南
常见问题与避坑指南 · 核心概念 · 实践要点
常见问题
避坑指南
30
课程总结与未来展望(AI辅助解读等)
课程总结与未来展望(AI辅助解读等) · 核心概念 · 实践要点
AI
课程总结
所属VIP或分类
同VIP:ACMG变异解读跨批次一致性校验与溯源
同VIP:ACMG多批次变异解读与临床报告构建
同VIP:IGV测序可视化与变异真实性验证