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生物信息学与 AI 制药工程
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《ADMET预测模型超参数搜索与训练调优》
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ADMET预测模型超参数搜索与训练调优
共计 30 章节
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01
ADMET预测概述
ADMET概念 · 重要性 · 应用场景及常用数据库
ADMET
预测概述
02
分子描述符与特征工程
分子描述符类型 · 特征提取与标准化
分子描述符
特征工程
03
数据集准备与预处理
数据收集 · 清洗 · 划分训练集/测试集
数据集准备
预处理
04
模型评估指标
准确率 · AUC · RMSE
模型评估指标
准确率
05
超参数调优基础
什么是超参数 · 为何需要调优 · 调优的常见策略
超参数调优基础
什么是超参数
06
网格搜索(Grid Search)
原理 · 实现 · 优缺点
Grid
Search
07
随机搜索(Random Search)
原理 · 实现 · 与网格搜索对比
Random
Search
08
贝叶斯优化(Bayesian Optimization)
原理 · 高斯过程 · EI等
Bayesian
Optimization
09
基于梯度的优化
学习率调度 · 梯度下降变体等
基于梯度的优化
学习率调度
10
进化算法(Evolutionary Algorithms)
遗传算法 · CMA-ES等
Evolutionary
Algorithms
11
超参数空间设计
如何定义搜索空间 · 离散/连续参数 · 条件参数
超参数空间设计
如何定义搜索空间
12
学习率调优
学习率范围测试 · 余弦退火 · 循环学习率等
学习率调优
学习率范围测试
13
批量大小调优
批量大小对训练影响 · 调优策略
批量大小调优
批量大小对训练影…
14
网络结构调优
层数 · 神经元数 · 激活函数
网络结构调优
层数
15
正则化参数调优
L1/L2正则化 · dropout率 · 权重衰减
正则化参数调优
L1/L2
16
损失函数选择
针对ADMET任务的损失函数(二元交… · MSE等)
损失函数选择
ADMET
17
优化器选择
SGD · Adam · RMSprop等及其超参数调优
优化器选择
SGD
18
早停与学习率衰减
早停策略 · ReduceLROnPlateau等
早停
学习率衰减
19
交叉验证策略
k折交叉验证 · 分层交叉验证 · 留一法等
交叉验证策略
k折交叉验证
20
多任务学习调优
共享层 · 任务权重 · 梯度归一化
多任务学习调优
共享层
21
集成学习调优
Bagging · Boosting · Stacking中的超参数
集成学习调优
Bagging
22
特征选择调优
基于模型的特征选择 · 递归特征消除等超参数
特征选择调优
基于模型的特征选…
23
数据增强调优
分子扰动 · SMOTE等超参数
数据增强调优
分子扰动
24
模型蒸馏调优
温度参数 · 软标签权重
模型蒸馏调优
温度参数
25
迁移学习调优
预训练模型选择 · 微调层数 · 学习率
迁移学习调优
预训练模型选择
26
自动机器学习(AutoML)
AutoML框架 · 神经架构搜索 · 超参数优化自动化
AutoML
自动机器学习
27
超参数调优工具实战
Optuna · Hyperopt · Ray Tune等使用
超参数调优工具实…
Optuna
28
实际案例
ADMET分类模型调优(如P-gp抑…
实际案例
ADMET
29
实际案例
ADMET回归模型调优(如Caco-…
实际案例
ADMET
30
调优结果分析与部署
可视化 · 最佳参数保存 · 模型部署
调优结果分析
部署
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