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ADMET批次效应影响分析实践

共计 30 章节
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01
ADMET概述与重要性
药物研发中ADMET的角色 · 批次效应问题的由来
ADMET重要性
02
批次效应概念与来源
实验批次 · 试剂批次 · 仪器漂移
批次效应概念来源
03
ADMET数据中的批次效应识别
箱线图 · 变异系数 · 批次相关性矩阵
ADMET数据
04
数据预处理与质量控制
缺失值处理 · 异常值检测 · 标准化方法（Z-score
数据预处理质量控制
05
主成分分析(PCA)在批次效应检测中的应用
PC批次聚类 · 载荷解释
PCA主成分分析
06
线性混合模型基础
固定效应与随机效应 · 批次作为随机效应
线性混合模型基础固定效应
07
Combat算法原理与实现
经验贝叶斯校正 · Python实战（pycombat）
Combat算法原理
08
limma包批次校正
线性模型处理基因表达数据 · 推广到ADMET
limma包批次校正
09
RUV (Remove Unwanted Variation)方法
负对照基因 · 因子分析
RUVRemove
10
其他批次校正方法
Harmony · scMerge · MNN校正
其他批次校正方法Harmony
11
ADMET数据标准化流程
内部标准品 · QC样本 · 归一化策略
ADMET数据标准化流程
12
吸收参数（Caco-2、MDCK）的批次效应分析
渗透性数据整合
Caco-2MDCK
13
分布参数（血浆蛋白结合、脑渗透）批次效应
结合率测定差异
分布参数血浆蛋白结合
14
代谢参数（肝微粒体稳定性、CYP抑制）批次效应
半衰期变异
CYP代谢参数
15
排泄参数（肾清除率、胆汁排泄）批次效应
清除率跨批次比较
排泄参数肾清除率
16
毒性参数（hERG、AMES、LD50）批次效应
体外体内不一致性
hERGAMES
17
多批次数据整合策略
元分析 · 合并后校正 · 加权融合
多批次数据整合策…元分析
18
批次效应评估指标
SSB/SSW比值 · 批次聚类系数 · Kruskal-Wallis检验
批次效应评估指标SSB/SSW
19
可视化批次效应
t-SNE · UMAP · 热图
可视化批次效应t-SNE
20
机器学习在批次效应检测中的应用
随机森林重要性 · 异常检测
机器学习批次效应检测
21
深度学习去除批次效应
变分自编码器（VAE） · 对抗网络
深度学习去除批次…VAE
22
交叉验证下的批次效应影响
留一批验证 · 时间序列拆分
交叉验证下的批次…留一批验证
23
案例
制药公司内部多批次ADMET数据校正
案例ADMET
24
案例
公共数据库（ChEMBL · PubChem）批次效应处理
案例ChEMBL
25
批量效应对QSAR模型性能的影响
训练集/测试集偏差
QSAR批量效应对
26
在模型训练中融入批次信息
批次作为特征 · 对抗正则化
模型训练融入批次信息
27
批次校正后的模型验证与迁移学习
跨批次预测能力评估
批次校正后的模型…迁移学习
28
自动化批次效应分析管道构建
Nextflow/Snakemake…
自动化批次效应分…Nextflow/Sna…
29
报告与文档化批次效应分析结果
可视化报告 · 生物统计学描述
报告文档化批次效应分…
30
前沿趋势与未来挑战
单细胞ADMET · 联邦学习批次问题 · AI质控
前沿趋势未来挑战