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ADMET分子描述符降维与特征选择

共计 30 章节
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01
ADMET概述与药物研发中的重要性
ADMET概述与药物研发中的重要性 · 核心概念 · 实践要点
ADMET药物研发
02
分子描述符概念与分类
分子描述符概念与分类 · 核心概念 · 实践要点
分子描述符概念分类
03
常用分子描述符计算工具介绍（RDKit、Mordred、PaDEL）
常用分子描述符计算工具介绍（RDKit · 核心概念 · 实践要点
RDKitMordred
04
环境搭建
Python · RDKit · Mordred安装
环境搭建Python
05
计算二维分子描述符实战
计算二维分子描述符实战 · 核心概念 · 实践要点
计算二维分子描述…重点
06
计算三维分子描述符实战
计算三维分子描述符实战 · 核心概念 · 实践要点
计算三维分子描述…重点
07
描述符数据预处理
缺失值处理
描述符数据预处理缺失值处理
08
描述符数据预处理
标准化与归一化
描述符数据预处理标准化
09
描述符相关性分析与冗余去除
描述符相关性分析与冗余去除 · 核心概念 · 实践要点
描述符相关性分析冗余去除
10
主成分分析（PCA）原理与数学基础
主成分分析（PCA）原理与数学基础 · 核心概念 · 实践要点
PCA主成分分析
11
PCA降维实战（使用scikit-learn）
PCA降维实战（使用scikit-lea… · 核心概念 · 实践要点
PCAscikit-learn
12
PCA结果可视化与解释
PCA结果可视化与解释 · 核心概念 · 实践要点
PCA结果可视化
13
t-分布随机邻域嵌入（t-SNE）原理
t-分布随机邻域嵌入（t-SNE）原理 · 核心概念 · 实践要点
tt-SNE
14
t-SNE降维实战与参数调优
t-SNE降维实战与参数调优 · 核心概念 · 实践要点
t-SNE降维实战
15
统一流形逼近与投影（UMAP）原理
统一流形逼近与投影（UMAP）原理 · 核心概念 · 实践要点
UMAP统一流形逼近
16
UMAP降维实战
UMAP降维实战 · 核心概念 · 实践要点
UMAP降维实战
17
线性判别分析（LDA）在描述符降维中的应用
线性判别分析（LDA）在描述符降维中的应… · 核心概念 · 实践要点
LDA线性判别分析
18
因子分析（FA）与描述符降维
因子分析（FA）与描述符降维 · 核心概念 · 实践要点
FA因子分析
19
特征选择
方差阈值法
特征选择方差阈值法
20
特征选择
卡方检验与互信息
特征选择卡方检验
21
特征选择
基于模型的特征重要性（随机森林 · XGBoost）
特征选择基于模型的特征重…
22
递归特征消除（RFE）实战
递归特征消除（RFE）实战 · 核心概念 · 实践要点
RFE递归特征消除
23
自编码器（Autoencoder）降维简介
自编码器（Autoencoder）降维简… · 核心概念 · 实践要点
Autoencoder自编码器
24
自编码器实现描述符降维（Keras）
自编码器实现描述符降维（Keras） · 核心概念 · 实践要点
Keras自编码器实现描述…
25
降维后模型性能评估（分类/回归任务）
降维后模型性能评估（分类/回归任务） · 核心概念 · 实践要点
降维后模型性能评…分类
26
降维结果的可解释性分析
降维结果的可解释性分析 · 核心概念 · 实践要点
降维结果的可解释…重点
27
实际案例
基于ADMET描述符的化合物毒性预测
实际案例ADMET
28
实际案例
口服生物利用度预测中的降维策略
实际案例口服生物利用度预…
29
超参数优化与降维方法选择
超参数优化与降维方法选择 · 核心概念 · 实践要点
超参数优化降维方法选择
30
课程总结
最佳实践与常见陷阱
课程总结最佳实践