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《QSAR药物分子批次质控与建模评估》
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QSAR药物分子批次质控与建模评估
共计 30 章节
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01
QSAR概述与药物研发中的应用
QSAR概述与药物研发中的应用 · 核心概念 · 实践要点
QSAR
药物研发
02
批次效应概念及对QSAR模型的影响
批次效应概念及对QSAR模型的影响 · 核心概念 · 实践要点
QSAR
批次效应概念
03
数据来源与收集
公共数据库与内部数据
数据来源
收集
04
数据清洗基础
缺失值处理
数据清洗基础
缺失值处理
05
数据清洗进阶
异常值检测与处理
数据清洗进阶
异常值检测
06
分子描述符计算基础(RDKit)
分子描述符计算基础(RDKit) · 核心概念 · 实践要点
RDKit
分子描述符计算基…
07
分子指纹简介与生成
分子指纹简介与生成 · 核心概念 · 实践要点
分子指纹简介
生成
08
特征选择方法(过滤法、包裹法、嵌入法)
特征选择方法(过滤法、包裹法、嵌入法) · 核心概念 · 实践要点
特征选择方法
过滤法
09
数据标准化与归一化
数据标准化与归一化 · 核心概念 · 实践要点
数据标准化
归一化
10
数据集划分
训练集 · 验证集 · 测试集
数据集划分
训练集
11
批次效应检测方法(PCA、t-SNE可视化)
批次效应检测方法(PCA · 核心概念 · 实践要点
PCA
t-SNE
12
批次效应校正方法(ComBat、Limma等)
批次效应校正方法(ComBat · 核心概念 · 实践要点
ComBat
Limma
13
交叉验证与留一法
交叉验证与留一法 · 核心概念 · 实践要点
交叉验证
留一法
14
线性回归模型在QSAR中的应用
线性回归模型在QSAR中的应用 · 核心概念 · 实践要点
QSAR
线性回归模型
15
随机森林与梯度提升树
随机森林与梯度提升树 · 核心概念 · 实践要点
随机森林
梯度提升树
16
支持向量机(SVM)建模
支持向量机(SVM)建模 · 核心概念 · 实践要点
SVM
支持向量机
17
神经网络与深度学习简介
神经网络与深度学习简介 · 核心概念 · 实践要点
神经网络
深度学习简介
18
模型评估指标(R²、RMSE、AUC等)
模型评估指标(R²、RMSE、AUC等) · 核心概念 · 实践要点
RMSE
AUC
19
过拟合与欠拟合诊断
过拟合与欠拟合诊断 · 核心概念 · 实践要点
过拟合
欠拟合诊断
20
模型可解释性(SHAP、LIME)
模型可解释性(SHAP、LIME) · 核心概念 · 实践要点
SHAP
LIME
21
质控工具
数据一致性检查
质控工具
数据一致性检查
22
质控工具
模型稳定性评估
质控工具
模型稳定性评估
23
批次标签的构建与管理
批次标签的构建与管理 · 核心概念 · 实践要点
批次标签的构建
管理
24
批次间重复性分析
批次间重复性分析 · 核心概念 · 实践要点
批次间重复性分析
重点
25
实战案例1
从头构建一个QSAR模型(流程)
实战案例1
QSAR
26
实战案例2
批次效应处理前后模型对比
实战案例2
批次效应处理前后…
27
实战案例3
使用AutoQSAR自动化建模
实战案例3
AutoQSAR
28
实战案例4
质控报告生成与解读
实战案例4
质控报告生成
29
项目管理与版本控制(Git for QSAR)
项目管理与版本控制(Git for QS… · 核心概念 · 实践要点
Git
for
30
课程总结与最佳实践
课程总结与最佳实践 · 核心概念 · 实践要点
课程总结
最佳实践
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