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生物信息学与 AI 制药工程
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《QSAR批次质控与迁移学习验证》
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QSAR批次质控与迁移学习验证
共计 30 章节
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01
QSAR批次质控概述
定义 · 重要性与应用场景
QSAR
批次质控概述
02
批次效应的来源与影响
实验批次差异 · 仪器漂移 · 试剂批次等
批次效应的来源
影响
03
数据标准化与归一化策略
Z-score · Min-Max · RobustScaler
数据标准化
归一化策略
04
异常值检测与处理
IQR法 · Z-score法 · DBSCAN
异常值检测
处理
05
训练集与测试集划分原则
随机划分 · 基于批次分层划分
训练集
测试集划分原则
06
交叉验证与批次划分
Leave-One-Batch-Ou… · Stratified CV
交叉验证
批次划分
07
批次效应可视化方法
PCA · t-SNE · UMAP图例分析
批次效应可视化方…
PCA
08
Combat方法原理与实现
使用pyCombat库
Combat
方法原理
09
基于PCA的批次校正
PCA后向投影去除批次分量
PCA
基于
10
基于limma的批次校正
线性模型调整
limma
基于
11
基于深度学习的批次校正
Autoencoder与对抗网络
基于深度学习的批…
Autoencoder
12
模型性能评估指标
R² · RMSE · MAE
模型性能评估指标
R²
13
批次一致性验证
批次间预测误差分布对比
批次一致性验证
批次间预测误差分…
14
批次间预测误差分析
ANOVA · Cohen's d
批次间预测误差分…
ANOVA
15
模型更新策略
重训练 · 增量学习 · 微调
模型更新策略
重训练
16
增量学习与批次适应
Streaming算法 · Online SGD
增量学习
批次适应
17
迁移学习在QSAR批次质控中的应用
Domain Adaptation
QSAR
迁移学习
18
基于对抗学习的域适应
Domain Adversarial…
基于对抗学习的域…
Domain
19
模型监控与预警
实时性能监控 · 漂移检测
模型监控
预警
20
漂移检测方法
PSI · KL散度 · KS检验
漂移检测方法
PSI
21
质控图与统计过程控制
Shewhart图 · CUSUM
质控图
统计过程控制
22
多批次数据融合策略
Mosaic组合与动态权重
多批次数据融合策…
Mosaic
23
建立批次质控流程图
从数据采集到报告生成
建立批次质控流程…
从数据采集到报告…
24
实战案例
公共数据集(如Tox21)批次校正
实战案例
Tox21
25
实战案例
企业内部QSAR模型批次质控(药物A…
实战案例
QSAR
26
实战案例
药物毒性预测中的批次处理(hERG等…
实战案例
hERG
27
工具与平台介绍
ComBat · sva(R包) · pycombat
工具
平台介绍
28
自动化质控管线搭建
Snakemake · Nextflow流程示例
自动化质控管线搭…
Snakemake
29
质控报告生成与解读
含统计图表与解释
质控报告生成
解读
30
QSAR批次质控的未来方向与挑战
联邦学习 · 自监督学习 · 标准化数据库
QSAR
批次质控的未来方…
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