VIP20
本课程属于：025-蛋白结构预测批次质控 生物信息学与 AI 制药工程 · 共 20 门相关课程，组合学习更完整。
查看所属VIP全部课程 →
← 返回所属目录 咨询 / 购买

QMEAN与Verify3D蛋白结构质量校验

共计 30 章节
点击此处阅读海量试读课程：100+行业、1000+细分领域
01
QMEAN与Verify3D简介
背景 · 目的 · 应用领域
QMEANVerify3D
02
工具安装
QMEAN与Verify3D的获取与…
工具安装QMEAN
03
依赖环境配置
Python · Java · R等依赖
依赖环境配置Python
04
蛋白质结构文件格式
PDB · mmCIF等
蛋白质结构文件格…PDB
05
QMEAN评分原理
能量 · 溶剂可及性等
QMEAN评分原理
06
QMEAN命令行使用
基本命令与参数
QMEAN命令行使用
07
QMEAN输出解释
全局评分 · 局部评分
QMEAN输出解释
08
QMEAN结果可视化
评分曲线 · 图谱
QMEAN结果可视化
09
Verify3D简介
3D-1D profile方法
Verify3D简介
10
Verify3D命令行使用
输入输出
Verify3D命令行使用
11
Verify3D输出解读
得分 · 窗口分析
Verify3D输出解读
12
Verify3D结果可视化
残基评分图
Verify3D结果可视化
13
集成动机
为什么需要联合验证
集成动机为什么需要联合验…
14
集成流程设计
整体架构
集成流程设计整体架构
15
数据预处理
结构清理 · 格式统一
数据预处理结构清理
16
编写Python脚本调用QMEAN
编写Python脚本调用QMEAN · 核心概念 · 实践要点
PythonQMEAN
17
编写Python脚本调用Verify3D
编写Python脚本调用Verify3D · 核心概念 · 实践要点
PythonVerify3D
18
集成脚本框架
模块化设计
集成脚本框架模块化设计
19
并发执行与性能优化
并发执行与性能优化 · 核心概念 · 实践要点
并发执行性能优化
20
结果合并与标准化
结果合并与标准化 · 核心概念 · 实践要点
结果合并标准化
21
生成综合报告
HTML报告包含两者结果
生成综合报告HTML
22
异常处理与错误日志
异常处理与错误日志 · 核心概念 · 实践要点
异常处理错误日志
23
案例1
同源建模模型验证
案例1同源建模模型验证
24
案例2
晶体结构评估
案例2晶体结构评估
25
案例3
AlphaFold模型验证
案例3AlphaFold
26
集成工具在PIPELINE中的应用
集成工具在PIPELINE中的应用 · 核心概念 · 实践要点
PIPELINE集成工具
27
与其它验证工具（如ProSA、MolProbity）比较
与其它验证工具（如ProSA · 核心概念 · 实践要点
ProSAMolProbity
28
常见问题及解决方法
常见问题及解决方法 · 核心概念 · 实践要点
常见问题解决方法
29
最佳实践
参数调优
最佳实践参数调优
30
未来展望
深度学习与结构验证
未来展望深度学习