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生物信息学与 AI 制药工程
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014-ADMET性质预测模型
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《ADMET预测模型超参数搜索与优化》
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本课程属于:014-ADMET性质预测模型
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ADMET预测模型超参数搜索与优化
共计 30 章节
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01
ADMET预测简介
ADMET的重要性与应用场景
ADMET
预测简介
02
常用ADMET参数
吸收 · 分布 · 代谢
ADMET
常用
03
分子描述符基础
数值化分子结构
分子描述符基础
数值化分子结构
04
分子指纹与图神经网络基础
分子指纹与图神经网络基础 · 核心概念 · 实践要点
分子指纹
图神经网络基础
05
数据获取与预处理
ChEMBL · PubChem等数据库
数据获取
预处理
06
特征工程
标准化 · 归一化 · 特征选择
特征工程
标准化
07
数据集划分
训练集 · 验证集 · 测试集
数据集划分
训练集
08
基线模型
线性回归 · 逻辑回归
基线模型
线性回归
09
决策树与随机森林在ADMET中的应用
决策树与随机森林在ADMET中的应用 · 核心概念 · 实践要点
ADMET
决策树
10
梯度提升机(XGBoost、LightGBM、CatBoost)
梯度提升机(XGBoost · 核心概念 · 实践要点
XGBoost
LightGBM
11
支持向量机与核方法
支持向量机与核方法 · 核心概念 · 实践要点
支持向量机
核方法
12
神经网络基础
MLP · Dropout · BatchNorm
神经网络基础
MLP
13
图神经网络(GNN)用于分子性质预测
图神经网络(GNN)用于分子性质预测 · 核心概念 · 实践要点
GNN
图神经网络
14
注意力机制与Transformer在ADMET中的应用
注意力机制与Transformer在AD… · 核心概念 · 实践要点
Transformer
ADMET
15
模型评估指标
ROC-AUC · R² · MAE
模型评估指标
ROC-AUC
16
超参数调优概述
为什么需要调优
超参数调优概述
为什么需要调优
17
网格搜索(Grid Search)理论与实践
网格搜索(Grid Search)理论与… · 核心概念 · 实践要点
Grid
Search
18
随机搜索(Random Search)理论与实践
随机搜索(Random Search)理… · 核心概念 · 实践要点
Random
Search
19
贝叶斯优化
原理与实现(scikit-optim… · Optuna)
贝叶斯优化
scikit-optim
20
遗传算法与进化策略调参
遗传算法与进化策略调参 · 核心概念 · 实践要点
遗传算法
进化策略调参
21
早停法与学习率调度
早停法与学习率调度 · 核心概念 · 实践要点
早停法
学习率调度
22
集成学习
Bagging · Boosting · Stacking
集成学习
Bagging
23
多任务学习
同时预测多个ADMET属性
多任务学习
ADMET
24
迁移学习
预训练模型微调
迁移学习
预训练模型微调
25
数据不平衡处理
过采样 · 欠采样 · SMOTE
数据不平衡处理
过采样
26
模型可解释性
SHAP · LIME · Permutation Import…
模型可解释性
SHAP
27
不确定性量化
MC Dropout · Ensemble
不确定性量化
MC
28
自动化机器学习(AutoML)在ADMET中的应用
自动化机器学习(AutoML)在ADME… · 核心概念 · 实践要点
AutoML
ADMET
29
端到端ADMET预测管线搭建
端到端ADMET预测管线搭建 · 核心概念 · 实践要点
ADMET
端到端
30
实战案例
从头到尾调优一个ADMET模型
实战案例
ADMET
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