第2章:常用ADMET参数:吸收、分布、代谢、排泄、毒性

今天我们来聊聊ADMET参数的核心。

做药物设计的朋友都懂,你合成了一堆化合物,体外活性好得不得了。但一上小鼠实验,要么吸收太差,要么毒性太大。说白了,ADMET就是帮你提前筛选掉那些“看起来很美”的分子。

我个人习惯,在项目早期就把这五个参数过一遍。不然后面砸几百万做临床,才发现问题,那可就真头疼了。

ADMET 五大参数全景图 吸收 (A) 分布 (D) 代谢 (M) 排泄 (E) 毒性 (T) Caco-2 | PAMPA 溶解度 | LogD Vd | PPB 血脑屏障 CYP450 | 半衰期 代谢稳定性 肾清除率 | 胆汁排泄 转运体介导 hERG | AMES | 肝毒性 致突变 | 急性毒性 核心原则 体外参数预测 ≠ 体内真实暴露 ADMET 是系统性问题,需要多参数联合评估

2.1 吸收 (Absorption)

一个分子进了肚子,首先会经历什么?就是吸收。

吸收不好,再好的药效也白搭。我见过一个项目,化合物在细胞实验里 EC50 达到纳摩尔级,结果口服生物利用度只有 1%。后来又花了一年多改结构,才把吸收提上去。

2.1.1 关键参数

  • Caco-2 渗透性:模拟人体肠道上皮细胞的吸收能力。一般认为 Papp > 1 × 10⁻⁶ cm/s 算中等以上。
  • PAMPA:纯被动扩散模型。速度快,适合早期筛选。
  • 溶解度:化合物在生理 pH 下的溶解程度。说白了,溶不出来就吸收不了。
  • LogD:脂水分配系数。pH 7.4 下的 LogD 最好在 1-3 之间。

我的一点经验:

Caco-2 值高不代表一定吸收好,还要看有没有外排机制。很多 P-gp 底物虽然渗透性好,但又被泵回肠腔,实际吸收大打折扣。

2.2 分布 (Distribution)

吸收之后,药去哪儿了?这就看分布。

我个人比较关注三个指标:表观分布容积 (Vd)、血浆蛋白结合率 (PPB)、以及血脑屏障透过性。

参数 含义 理想范围
Vd (L/kg) 药物在体内的分布程度 0.5 - 10
PPB (%) 与血浆蛋白结合的比例 偏低更好(>99% 容易结合过强)
中枢神经透过 能否进入脑组织 视靶点而定

避坑提醒:

我曾经犯过一个错误:只看总药浓度,没关注游离药物浓度。结果一个化合物蛋白结合率 99.9%,游离浓度几乎为零,体外活性再高也是白搭。

2.3 代谢 (Metabolism)

代谢是药物在体内的“改造”过程。说白了,肝脏里的酶把分子氧化、还原、水解,变成更容易排出去的东西。

这里面最重要的就是细胞色素 P450 酶系(CYP450)。如果你设计了一个对 CYP3A4 高度依赖的分子,那它的代谢速度可能很快,半衰期很短。

2.3.1 代谢稳定性

常用微粒体或肝细胞实验来评估。半衰期 (t₁/₂) 越长,表示代谢越慢,药效持续时间越长。

# 计算固有清除率 (CLint)
CL_int = ln(2) / t_1/2 * (孵育体积) / (微粒体蛋白量)
# 单位: μL/min/mg protein

实用技巧:

如果你发现化合物代谢太快,通常可以这样改结构:

  1. 在代谢热点引入氟原子(F)或三氟甲基(CF₃)
  2. 把易氧化芳环换成吡啶或嘧啶
  3. 增加位阻,让酶不容易接近

2.4 排泄 (Excretion)

排泄就是药物怎么从体内出去的。主要途径是肾和肝。

肾清除率 (CLr) 和胆汁排泄是核心指标。如果清除太快,药效维持时间短;清除太慢,又容易蓄积中毒。

2.4.1 转运体介导的排泄

  • OAT / OATP:摄取型转运体,把药送到肝细胞里。
  • MRP2 / BCRP:外排型转运体,把药排到胆汁里。
  • P-gp:前面提过的,在肠道和肾脏都参与排泄。

关键规律:

排泄参数往往和分布参数联动。一个高 Vd 的脂溶性分子,通常肾清除率低,容易在体内蓄积。这时候就要特别小心毒性。

2.5 毒性 (Toxicity)

最后,也是最让人头疼的——毒性。

做 ADMET 预测的朋友都知道,毒性预测准确率一直不高。但有几个参数是业内公认必须看的。

毒性终点 常用模型 阈值参考
hERG 抑制 电生理 / 预测模型 IC50 > 10 μM (安全)
AMES 致突变 细菌回复突变 阴性 (无致突变)
肝毒性 HepG2 / ALT/AST TC50 > 50 μM
急性毒性 LD50 (大鼠 / 小鼠) 口服 LD50 > 500 mg/kg

重要提醒:

别再只依赖一个毒性参数!hERG 阴性不代表没有肝毒性。我见过一个项目,hERG 漂亮得很,结果临床一期出了肝损伤。教训就是:毒性要多个维度综合看。

2.6 常用 ADMET 预测模型对照

上面讲了这么多参数,那用什么工具来算呢?

我整理了一个表格,把几个主流模型或者规则和对应的 ADMET 参数配对了一下。你想想看,平时做筛选的时候可以直接对着来。

参数类别 模型 / 规则 输入特征
吸收 Lipinski 五规则 MW, LogP, HBD, HBA
分布 Vd 预测 (QSPR) LogD, PSA, 电离常数
代谢 CYP 底物分类器 分子指纹, 电荷分布
排泄 肾清除率回归 蛋白结合, Vd, LogD
毒性 hERG 分类器 pKa, LogP, 芳香环数

嗯,到这里,ADMET 的五类核心参数就捋得差不多了。

其实真正实战的时候,你会发现这些参数之间会互相影响。比如提高代谢稳定性,可能一不小心把溶解度搞差了。这就是为什么我们后面要把它们放在一起调优。