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生物信息学与 AI 制药工程
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006-受监管生信工作流审计
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《受监管Pipeline版本控制与自动化部署》
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受监管Pipeline版本控制与自动化部署
共计 30 章节
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01
版本控制基础
Git原理 · 工作区与仓库 · 常用命令(init
版本控制基础
Git
02
分支管理
分支概念 · 创建与切换 · 合并(merge)
分支管理
分支概念
03
Git工作流
Git Flow · GitHub Flow · GitLab Flow对比与实践选择
Git
工作流
04
远程仓库协作
远程仓库配置 · 推送与拉取 · Pull Request / Mer…
远程仓库协作
远程仓库配置
05
标签与版本发布
Git tag分类 · 语义化版本规范(SemVer) · Release管理
标签
版本发布
06
Pipeline概述
CI/CD概念 · 持续集成与持续部署的价值 · 常见工具选型
Pipeline
CI/CD
07
Jenkins Pipeline基础
Jenkins安装配置 · Freestyle与Pipeline… · Jenkinsfile结构
Jenkins
Pipeline
08
Jenkins Pipeline语法
声明式Pipeline vs 脚本式… · stage/step定义
Jenkins
Pipeline
09
Pipeline环境变量
内置变量 · 自定义变量 · 凭据管理(Credentials)
Pipeline
环境变量
10
Pipeline触发方式
定时触发 · SCM轮询 · Webhook触发
Pipeline
触发方式
11
Pipeline并行与串行
并行阶段执行 · 节点分配 · 锁机制
Pipeline
并行
12
Pipeline中的Docker
Docker Pipeline插件 · 构建Docker镜像 · 运行容器化构建
Pipeline
Docker
13
GitLab CI/CD
.gitlab-ci.yml配置 · Runner安装与注册 · Job与Stage定义
GitLab
CI/CD
14
GitLab CI/CD高级
artifacts · cache · environments
GitLab
CI/CD
15
GitHub Actions
Workflow文件结构 · 事件触发 · Job与Step
GitHub
Actions
16
GitHub Actions进阶
环境变量 · Secrets · 矩阵构建
GitHub
Actions
17
配置文件版本控制
配置与代码分离 · YAML/JSON/TOML管理 · 环境变量注入
配置文件版本控制
配置
18
依赖管理版本控制
依赖锁文件(lock file) · 包管理器(npm · pip
依赖管理版本控制
lock
19
Docker镜像版本控制
Dockerfile版本化 · 镜像标签策略 · 多阶段构建
Docker
镜像版本控制
20
基础设施即代码(IaC)
Terraform/Pulumi版本… · state文件管理 · 模块化
IaC
基础设施即代码
21
Pipeline代码版本控制
Jenkinsfile/GitLab… · 分支策略对齐
Pipeline
代码版本控制
22
测试自动化集成
单元测试 · 集成测试 · 端到端测试在Pipeline中的集成
测试自动化集成
单元测试
23
质量门禁与安全扫描
SonarQube代码质量 · Trivy安全扫描 · License检查
质量门禁
安全扫描
24
发布与回滚策略
蓝绿部署 · 金丝雀发布 · 回滚机制在Pipeline中的实现
发布
回滚策略
25
Changelog与Release Notes
自动生成Changelog · 基于Git Tag的版本日志
Changelog
Release
26
Secret管理
Vault/AWS Secrets… · Pipeline中的敏感信息保护
Secret
管理
27
Pipeline监控与日志
Pipeline运行状态监控 · 日志聚合 · 告警通知
Pipeline
监控
28
Pipeline模板化与复用
共享库(Jenkins Shared… · GitLab CI include · Actions复合动作
Pipeline
模板化
29
多项目Pipeline管理
Monorepo vs Multi-… · 依赖构建顺序 · 整体视图
Pipeline
多项目
30
Pipeline最佳实践总结
Pipeline as Code · 不可变构建 · 可追溯性
Pipeline
最佳实践总结
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