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PyMOL与ChimeraX可视化分析指南

共计 30 章节
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01
PyMOL入门
发展史 · 应用场景 · 安装与配置
PyMOL发展史
02
PyMOL基本界面与操作
菜单 · 命令行 · 鼠标操作
PyMOL基本界面
03
PyMOL对象与文件格式
PDB · SDF · MOL2等导入导出
PyMOL对象
04
PyMOL选择与显示
选择语法 · 颜色 · 表示方式（卡通
PyMOL选择
05
PyMOL测量与交互
距离 · 角度 · 二面角测量
PyMOL测量
06
PyMOL序列视图与突变
序列比对 · 突变建模
PyMOL序列视图
07
PyMOL脚本基础
命令行脚本 · Python API入门
PyMOL脚本基础
08
PyMOL高级脚本
循环 · 条件 · 函数
PyMOL高级脚本
09
PyMOL插件与扩展
安装插件 · 常用插件介绍
PyMOL插件
10
PyMOL动画与分子动力学轨迹
加载轨迹 · 制作动画
PyMOL动画
11
PyMOL图像与影片导出
高质量渲染设置 · 导出格式
PyMOL图像
12
PyMOL对接结果可视化
加载对接pose · 分析相互作用
PyMOL对接结果可视化
13
ChimeraX入门
发展史 · 安装 · 启动与基本界面
ChimeraX发展史
14
ChimeraX视图与导航
旋转 · 平移 · 缩放
ChimeraX视图
15
ChimeraX文件管理
打开多种格式 · 保存会话
ChimeraX文件管理
16
ChimeraX选择与命令行
选择语法 · 命令概述
ChimeraX选择
17
ChimeraX分子表示
原子属性 · 颜色 · 表示样式
ChimeraX分子表示
18
ChimeraX测量与标注
距离 · 角度 · 氢键标注
ChimeraX测量
19
ChimeraX序列与结构比对
序列对齐 · 结构叠加
ChimeraX序列
20
ChimeraX表面与静电势
计算表面 · 显示静电势
ChimeraX表面
21
ChimeraX分子动力学
加载轨迹 · 分析RMSD · RMSF
ChimeraX分子动力学
22
ChimeraX交互式操作与脚本
GUI操作记录 · 脚本语言
ChimeraX交互式操作
23
ChimeraX体积数据可视化
Density map · ChimeraX Volume vi…
ChimeraX体积数据可视化
24
ChimeraX对接与虚拟筛选
AutoDock Vina集成 · 结果分析
ChimeraX对接
25
ChimeraX高级渲染与视频
光线追踪 · 视频录制
ChimeraX高级渲染
26
PyMOL与ChimeraX互操作
文件转换 · 协同工作流
PyMOLChimeraX
27
实战案例1
蛋白质-配体结合模式分析（使用PyM…
实战案例1PyM
28
实战案例2
蛋白质结构比对与构象变化（使用Chi…
实战案例2Chi
29
实战案例3
分子动力学轨迹分析与可视化（结合二者…
实战案例3分子动力学轨迹分…
30
综合项目
从结构获取到发表级图片的制作流程
综合项目从结构获取到发表…