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本课程属于：029-药物知识图谱靶点发现与重定位工程 生命科学与数字医疗 · 共 14 门相关课程，组合学习更完整。
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药物靶点发现数据整合工程

共计 30 章节
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01
药物靶点发现数据整合工程导论
目标=课程定位 · 核心问题 · 数据整合在靶点发现中的工程价值与典型…
药物靶点发现数据…目标=课程定位
02
靶点发现的数据生态
目标=基因组 · 转录组 · 蛋白质组
靶点发现的数据生…目标=基因组
03
公共数据库与知识库概览
目标=Ensembl · UniProt · GEO
公共数据库知识库概览
04
数据获取与API工程
目标=从公共数据库批量拉取靶点相关数… · 使用REST API · FTP
API数据获取
05
数据格式与标准化
目标=FASTA · VCF · BED
数据格式标准化
06
标识符映射与实体归一化
目标=基因 · 蛋白 · 变异
标识符映射实体归一化
07
数据质量评估与清洗
目标=缺失值 · 重复记录 · 批次效应
数据质量评估清洗
08
元数据管理与数据溯源
目标=实验条件 · 样本属性 · 处理步骤的元数据建模
元数据管理数据溯源
09
靶点相关组学数据整合
目标=多组学数据在基因 · 转录 · 蛋白层面的对齐
靶点相关组学数据…目标=多组学数据
10
变异数据整合与靶点可成药性
目标=从突变 · 拷贝数变异 · 融合基因到靶点功能影响与可干预性评估…
变异数据整合靶点可成药性
11
表达与调控数据整合
目标=转录组 · 表观遗传与调控网络数据整合 · 识别靶点的表达调控证据
表达调控数据整合
12
蛋白质结构与相互作用数据整合
目标=PDB · AlphaFold · STRING
蛋白质结构相互作用数据整合
13
通路与网络数据整合
目标=KEGG · Reactome · WikiPathways等通路数据与…
通路网络数据整合
14
疾病关联数据整合
目标=GWAS · 罕见病变异 · 疾病本体与临床表型数据整合
疾病关联数据整合GWAS
15
文献与专利数据整合
目标=PubMed · 专利文本挖掘与知识抽取 · 用于靶点证据发现与竞争态势分析
文献专利数据整合
16
知识图谱构建
目标=以靶点为中心的实体 · 关系 · 证据建模
知识图谱构建目标=以靶点为
17
图数据查询与推理
目标=Cypher · SPARQL等查询语言 · 基于图规则的靶点关联发现与证据路径推…
图数据查询推理
18
数据融合与证据加权
目标=多源证据的置信度评估 · 加权融合 · 冲突消解与靶点优先级排序
数据融合证据加权
19
机器学习特征工程
目标=从整合数据中构建靶点特征矩阵 · 包括组学 · 网络
机器学习特征工程目标=从整合数据
20
靶点发现中的监督学习
目标=分类与排序模型用于靶点-疾病关… · 可成药性预测与验证优先级排序
靶点发现监督学习
21
靶点发现中的无监督与表示学习
目标=聚类 · 矩阵分解 · 图嵌入与自编码器在靶点模块发现中的应…
靶点发现无监督
22
网络传播与因果推断
目标=基于网络扩散 · 随机游走与因果推断方法从整合数据中识…
网络传播因果推断
23
靶点优先级排序实战
目标=整合多组学与知识库数据 · 构建评分体系并输出可解释的靶点候选列…
靶点优先级排序实…目标=整合多组学
24
数据整合管道工程化
目标=工作流引擎 · 容器化 · 调度
数据整合管道工程…目标=工作流引擎
25
数据存储与查询优化
目标=关系型 · 列式 · 图与向量数据库在靶点数据整合中的选型
数据存储查询优化
26
数据安全、合规与伦理
目标=隐私保护 · 数据授权 · 去标识化与药物靶点数据使用中的合规要…
数据安全合规
27
可视化与交互式探索
目标=靶点证据网络 · 热图 · 火山图
可视化交互式探索
28
案例研究一
目标=肿瘤靶点发现中的数据整合 · GEO · Open Targets等数据到候选…
案例研究一目标=肿瘤靶点发…
29
案例研究二
目标=免疫与炎症靶点发现中的数据整合 · 通路与疾病关联数据识别可干预靶点
案例研究二目标=免疫
30
课程综合项目与前沿展望
目标=完成端到端靶点发现数据整合项目 · 讨论AI · 多模态与真实世界数据带来的新机遇
课程综合项目前沿展望