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生命科学与数字医疗
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029-药物知识图谱靶点发现与重定位工程
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《疾病药物关联建模工程》
VIP14
本课程属于:029-药物知识图谱靶点发现与重定位工程
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疾病药物关联建模工程
共计 30 章节
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01
疾病药物关联建模工程导论
目标=课程定位 · 核心任务 · 工程化流程与关键挑战
疾病药物关联建模…
目标=课程定位
02
疾病与药物数据资源全景
目标=公共数据库 · 知识图谱 · 文献挖掘与真实世界数据来源
疾病
药物数据资源全景
03
疾病本体与药物本体构建
目标=标准化术语 · 层级关系 · 语义映射与本体对齐方法
疾病本体
药物本体构建
04
关联数据获取与清洗
目标=API调用 · 爬虫策略 · 去重
关联数据获取
清洗
05
疾病-药物关联表示学习
目标=网络表示 · 知识图谱嵌入与多模态特征融合方法
疾病
药物关联表示学习
06
基于矩阵分解的关联预测
目标=协同过滤 · 隐语义模型与冷启动问题处理
基于矩阵分解的关…
目标=协同过滤
07
基于图神经网络的关联建模
目标=GCN · GAT · RGCN在疾病-药物异构图中的应用
基于图神经网络的…
GCN
08
基于深度学习的关联预测
目标=MLP · CNN · Transformer与自监督学习策…
基于深度学习的关…
MLP
09
知识图谱推理与链接预测
目标=TransE · DistMult · ComplEx与规则增强推理
知识图谱推理
链接预测
10
多源证据融合建模
目标=文献证据 · 临床试验 · 基因表达与副作用数据的整合
多源证据融合建模
目标=文献证据
11
疾病-药物关联特征工程
目标=拓扑特征 · 语义特征 · 统计特征与嵌入特征构建
疾病
药物关联特征工程
12
关联模型训练与调优
目标=损失函数设计 · 负采样策略 · 超参数搜索与正则化
关联模型训练
调优
13
模型评估与验证
目标=交叉验证 · 时间切分 · AUC
模型评估
验证
14
可解释性与因果推断
目标=注意力机制 · 路径解释 · 反事实推理与生物医学验证
可解释性
因果推断
15
药物重定位实战
目标=从疾病靶点到候选药物的关联建模…
药物重定位实战
目标=从疾病靶点…
16
药物不良反应关联预测
目标=FAERS数据 · 信号检测与风险关联建模
药物不良反应关联…
FAERS
17
组合药物与疾病关联建模
目标=药物协同 · 拮抗与多药联用场景分析
组合药物
疾病关联建模
18
罕见病药物关联发现
目标=小样本学习 · 迁移学习与数据增强策略
罕见病药物关联发…
目标=小样本学习
19
肿瘤精准用药关联建模
目标=基因组特征 · 通路分析与个性化推荐
肿瘤精准用药关联…
目标=基因组特征
20
传染病与药物关联建模
目标=病毒-宿主相互作用 · 抗病毒药物筛选与变异影响
传染病
药物关联建模
21
神经精神疾病药物关联建模
目标=脑影像 · 行为数据与多模态融合
神经精神疾病药物…
目标=脑影像
22
关联模型部署与工程化
目标=模型压缩 · API服务 · 批处理与实时推理架构
关联模型部署
工程化
23
持续学习与动态更新
目标=增量学习 · 概念漂移检测与在线更新机制
持续学习
动态更新
24
隐私保护与联邦学习
目标=跨机构数据协作 · 差分隐私与安全聚合
隐私保护
联邦学习
25
模型公平性与偏差分析
目标=数据偏差 · 算法公平性评估与缓解策略
模型公平性
偏差分析
26
大规模关联网络可视化
目标=图布局 · 交互探索与临床决策支持界面
大规模关联网络可…
目标=图布局
27
基准数据集与竞赛解析
目标=BioSNAP · DrugBank · CTD与相关挑战赛任务
基准数据集
竞赛解析
28
论文复现与前沿方法
目标=最新顶会模型复现 · 消融实验与改进思路
论文复现
前沿方法
29
端到端项目实战
目标=从需求分析 · 数据构建 · 建模到评估的完整工程案例
端到端项目实战
目标=从需求分析
30
课程总结与未来方向
目标=技术趋势 · 开放问题与跨学科合作展望
课程总结
未来方向
所属VIP或分类
同VIP:多组学药物重定位分析工程
同VIP:多组学靶点发现工程
同VIP:生物医学实体关系抽取工程