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分子图神经网络建模工程

共计 30 章节
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01
分子图神经网络建模工程导论
目标=课程目标 · 分子图表示的核心思想 · 工程化建模流程与典型应用场景
分子图神经网络建…目标=课程目标
02
分子图数据获取与预处理
目标=从SMILES · SDF · MOL2等格式构建分子图
分子图数据获取预处理
03
分子图表示与特征体系
目标=原子节点特征 · 化学键边特征 · 全局分子描述符
分子图表示特征体系
04
图神经网络基础回顾
目标=消息传递范式 · 聚合与更新机制 · GCN
图神经网络基础回…目标=消息传递范…
05
分子图神经网络模型设计
目标=针对分子图的节点嵌入 · 边嵌入 · 读出函数与端到端建模架构
分子图神经网络模…目标=针对分子图…
06
分子性质预测任务建模
目标=溶解度 · 毒性 · 血脑屏障渗透性等回归与分类任务的图神…
分子性质预测任务…目标=溶解度
07
分子图数据划分与评估
目标=随机划分 · 骨架划分 · 时间划分策略
分子图数据划分评估
08
分子图神经网络训练工程
目标=损失函数选择 · 优化器配置 · 学习率调度
分子图神经网络训…目标=损失函数选…
09
过平滑与过挤压问题实战
目标=分子图深层GNN的退化现象诊断 · 残差连接 · 跳跃连接与归一化策略
过平滑过挤压问题实战
10
分子图批处理与高效训练
目标=稀疏批处理 · 动态批大小 · GPU内存优化与大规模分子数据集加载
分子图批处理高效训练
11
分子图数据增强与自监督学习
目标=原子掩码 · 键掩码 · 对比学习
分子图数据增强自监督学习
12
分子生成模型与图神经网络
目标=基于VAE · GAN · 扩散模型的分子图生成
分子生成模型图神经网络
13
分子图神经网络可解释性
目标=注意力可视化 · 子结构归因 · GNNExplainer在化学任务中…
分子图神经网络可…目标=注意力可视…
14
分子图神经网络的不确定性量化
目标=贝叶斯神经网络 · 深度集成 · MC Dropout在分子性质预测中…
分子图神经网络的…目标=贝叶斯神经…
15
多任务与迁移学习分子图建模
目标=多性质联合预测 · 领域自适应 · 少样本分子图学习的工程方案
多任务迁移学习分子图建…
16
三维分子图与几何图神经网络
目标=构象生成 · 距离与角度特征 · SchNet
三维分子图几何图神经网络
17
分子图神经网络与分子动力学
目标=势能面学习 · 力场预测 · 能量守恒约束的图神经网络建模
分子图神经网络分子动力学
18
反应图神经网络建模
目标=化学反应图表示 · 原子映射 · 反应产率预测与逆合成路径的图神经网络…
反应图神经网络建…目标=化学反应图…
19
分子图神经网络在药物发现中的应用
目标=虚拟筛选 · ADMET预测 · 靶点亲和力建模的工程案例
分子图神经网络药物发现
20
分子图神经网络在材料发现中的应用
目标=晶体图 · 聚合物图 · 催化剂图的性质预测与逆向设计
分子图神经网络材料发现
21
分子图神经网络模型压缩与部署
目标=剪枝 · 量化 · 知识蒸馏
分子图神经网络模…部署
22
分子图神经网络工程化流水线
目标=数据版本管理 · 实验跟踪 · 模型注册
分子图神经网络工…目标=数据版本管…
23
分子图神经网络超参数优化
目标=贝叶斯优化 · 早停策略 · 多目标优化与自动化机器学习工具
分子图神经网络超…目标=贝叶斯优化
24
分子图神经网络鲁棒性与分布外泛化
目标=对抗攻击 · 噪声标签 · 骨架偏移与领域泛化工程方法
分子图神经网络鲁…分布外泛化
25
分子图神经网络与量子化学融合
目标=量子化学描述符 · DFT计算数据 · 多保真度图神经网络建模
分子图神经网络量子化学融合
26
分子图神经网络与蛋白质图联合建模
目标=蛋白质-配体相互作用图 · 对接姿态图 · 亲和力预测工程
分子图神经网络蛋白质图联合建模
27
分子图神经网络在环境与毒理中的应用
目标=污染物降解预测 · 生态毒性建模 · 监管级模型验证
分子图神经网络环境
28
分子图神经网络前沿架构
目标=Transformer图模型 · 等变图神经网络 · 图基础模型在分子领域的进展
分子图神经网络前…Transformer
29
分子图神经网络建模工程实战项目一
目标=从零构建一个分子溶解度预测系统 · 涵盖数据 · 模型
分子图神经网络建…目标=从零构建一…
30
分子图神经网络建模工程实战项目二
目标=构建一个多任务分子毒性预测平台 · 涵盖部署 · 解释与不确定性报告
分子图神经网络建…目标=构建一个多…