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ADMET模型验证与适用域评估

共计 30 章节
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01
ADMET预测与模型验证概览
目标=ADMET性质定义 · 建模流程 · 验证与适用域在药物研发中的角色
ADMET预测
02
数据质量与预处理实战
目标=数据清洗 · 缺失值处理 · 异常值检测
数据质量预处理实战
03
ADMET数据集划分策略
目标=随机划分 · 骨架划分 · 时间划分
ADMET数据集划分策略
04
回归模型验证指标
目标=R² · RMSE · MAE
回归模型验证指标目标=R²
05
分类模型验证指标
目标=准确率 · 召回率 · 精确率
分类模型验证指标目标=准确率
06
交叉验证与重复采样
目标=k折 · 留一法 · 重复k折
交叉验证重复采样
07
外部验证与时间验证
目标=独立测试集构建 · 时间外推验证 · 跨批次/跨实验室验证的实施要点
外部验证时间验证
08
模型校准与概率输出
目标=校准曲线 · Brier分数 · Platt缩放
模型校准概率输出
09
适用域基本概念
目标=定义 · 外推与内插 · 适用域与模型置信度的关系
适用域基本概念目标=定义
10
基于距离的适用域方法
目标=马氏距离 · 欧氏距离 · k近邻距离
基于距离的适用域…目标=马氏距离
11
基于相似性的适用域方法
目标=Tanimoto相似度 · 分子指纹 · 最近邻相似度阈值与可视化
基于相似性的适用…Tanimoto
12
基于集合与概率的适用域方法
目标=凸包 · 包围盒 · 局部密度
基于集合概率的适用域方法
13
适用域阈值选择与评估
目标=阈值优化 · 覆盖率-误差权衡 · 适用域内外的性能对比分析
适用域阈值选择评估
14
适用域与模型不确定性的整合
目标=预测区间 · 贝叶斯方法 · 集成方差与适用域联合决策
适用域模型不确定性的整…
15
ADMET分类模型验证实战
目标=以hERG或CYP抑制为例 · 完成数据划分 · 训练
ADMET分类模型验证实战
16
ADMET回归模型验证实战
目标=以溶解度或LogD为例 · 完成模型训练 · 外部验证与误差分析
ADMET回归模型验证实战
17
适用域计算实战
目标=对给定ADMET数据集计算多种…
适用域计算实战ADMET
18
适用域在虚拟筛选中的应用
目标=用适用域过滤化合物库 · 优先选择可信预测 · 降低假阳性
适用域虚拟筛选
19
模型验证中的数据泄漏识别与避免
目标=特征泄漏 · 划分泄漏 · 预处理泄漏
模型验证数据泄漏识别
20
ADMET模型验证的统计显著性
目标=置信区间 · 假设检验 · 效应量
ADMET模型验证的统计显…
21
模型可解释性与适用域
目标=SHAP · 部分依赖图 · 特征重要性如何辅助判断适用域边界
模型可解释性适用域
22
多任务与多性质ADMET模型验证
目标=多任务学习 · 缺失标签 · 任务相关性对验证与适用域的影响
ADMET多任务
23
ADMET模型验证报告与文档
目标=模型卡片 · 数据卡片 · 验证报告模板
ADMET模型验证报告
24
监管与工业界要求
目标=OECD验证原则 · FDA/EMA指南 · ICH M7等对ADMET模型验证与…
监管工业界要求
25
案例研究
目标=成功与失败的ADMET模型验证
案例研究ADMET
26
自动化验证流水线构建
目标=使用Python/R脚本 · 工作流工具实现数据划分 · 训练
自动化验证流水线…Python/R
27
适用域评估的基准与挑战
目标=公开基准数据集 · 评估指标 · 当前方法局限与开放问题
适用域评估的基准挑战
28
ADMET模型生命周期管理
目标=版本控制 · 监控 · 再训练触发
ADMET模型生命周期管理
29
前沿方向
目标=迁移学习 · 主动学习 · 图神经网络
前沿方向目标=迁移学习
30
课程总结与项目实战
目标=综合运用验证与适用域方法完成一…
课程总结项目实战