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MRM框架下特征筛选清单制作教程

共计 30 章节
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01
MRM概述
MRM（多反应监测）技术原理 · 在蛋白质组学与代谢组学中的应用 · MRM数据特点
MRM多反应监测
02
特征筛选概念
特征筛选在MRM数据分析中的重要性 · 特征筛选与降维的区别 · 特征筛选的目标
特征筛选概念MRM
03
MRM数据预处理
原始数据导入 · 缺失值处理 · 数据归一化与标准化
MRM数据预处理
04
特征筛选清单概念
什么是特征筛选清单 · 清单的组成要素（特征名 · 统计量
特征筛选清单概念什么是特征筛选清…
05
清单制作流程总览
从原始数据到最终清单的完整流程图 · 各阶段输入输出 · 关键决策点
清单制作流程总览从原始数据到最终…
06
数据质量评估
信噪比计算 · 峰面积重复性评估 · 缺失率统计
数据质量评估信噪比计算
07
缺失值处理策略
缺失率阈值设定 · 均值/中位数填补 · KNN填补
缺失值处理策略缺失率阈值设定
08
方差过滤法
低方差特征识别 · 方差阈值选择 · 方差过滤在MRM中的应用场景
方差过滤法低方差特征识别
09
相关系数法
皮尔逊相关系数计算 · 特征间高度相关识别 · 冗余特征剔除策略
相关系数法皮尔逊相关系数计…
10
单变量统计筛选
t检验与Wilcoxon秩和检验 · p值计算与多重假设检验校正（FDR/…
单变量统计筛选Wilcoxon
11
效应量评估
Cohen's d计算 · 折叠变化（Fold Change）计… · 效应量与p值联合筛选
效应量评估Cohen
12
随机森林特征重要性
随机森林模型构建 · 特征重要性评分（Gini重要性/置换… · 重要性阈值设定
随机森林特征重要…随机森林模型构建
13
LASSO回归筛选
LASSO原理简介 · 正则化参数λ选择 · 非零系数特征提取
LASSO回归筛选
14
递归特征消除（RFE）
RFE算法原理 · 基模型选择（SVM/随机森林） · RFE在MRM数据上的应用
RFE递归特征消除
15
Boruta算法
Boruta原理（影子特征与随机森林… · 决策规则 · Boruta在特征筛选中的优势
Boruta算法
16
稳定性选择
子采样策略 · 特征选择频率统计 · 稳定性阈值设定
稳定性选择子采样策略
17
多方法集成策略
投票法（硬投票/软投票） · 交集法 · 并集法
多方法集成策略投票法
18
特征筛选清单模板设计
Excel/CSV模板字段设计（特征… · 名称 · 统计量
特征筛选清单模板…Excel/CSV
19
清单自动化生成脚本
Python脚本框架（pandas数… · scikit-learn特征选择 · 结果汇总）
清单自动化生成脚…Python
20
清单结果可视化
火山图（Volcano Plot） · 特征重要性条形图 · 相关性热图
清单结果可视化Volcano
21
筛选阈值确定方法
经验阈值法 · 数据驱动阈值法（如拐点法） · 交叉验证辅助阈值选择
筛选阈值确定方法经验阈值法
22
过拟合防范
交叉验证在特征筛选中的应用 · 独立验证集设计 · 特征筛选稳定性评估
过拟合防范交叉验证
23
生物学可解释性验证
特征与通路关联分析 · 文献回溯验证 · 专家评审流程
生物学可解释性验…特征
24
清单版本控制
版本号管理 · 变更记录表 · 清单更新流程
清单版本控制版本号管理
25
案例实战1——蛋白质组学MRM数据
数据集介绍 · 完整筛选流程演示 · 最终清单解读
MRM案例实战1
26
案例实战2——代谢组学MRM数据
数据集介绍 · 与蛋白质组学筛选差异 · 清单结果对比
MRM案例实战2
27
常见问题与解决方案
高维小样本问题 · 多重共线性处理 · 筛选结果不一致处理
常见问题解决方案
28
清单质量评估指标
筛选稳定性指数 · 复现率 · 预测模型性能（AUC/准确率）
清单质量评估指标筛选稳定性指数
29
自动化报告生成
基于Jinja2模板的HTML报告生… · 报告内容结构（方法 · 结果
自动化报告生成Jinja2
30
课程总结与进阶方向
MRM特征筛选最佳实践总结 · 深度学习特征筛选简介 · 多组学整合筛选展望
课程总结进阶方向