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生物技术_生物工程与智能实验室
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021-流式细胞与显微成像实验
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《细胞形态学成像分析工程》
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细胞形态学成像分析工程
共计 30 章节
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01
课程导入与工程全景
目标=细胞形态学成像分析工程的定义 · 目标 · 典型应用场景
课程导入
工程全景
02
细胞形态学基础与成像对象
目标=细胞结构 · 形态特征 · 染色原理
细胞形态学基础
成像对象
03
显微成像系统与图像采集工程
目标=光学显微镜 · 共聚焦 · 高内涵成像系统的组成
显微成像系统
图像采集工程
04
图像预处理与增强
目标=去噪 · 背景校正 · 光照不均校正
图像预处理
增强
05
细胞分割基础
目标=阈值分割 · 边缘检测 · 区域生长
细胞分割基础
目标=阈值分割
06
基于深度学习的细胞分割
目标=U-Net · Mask R-CNN · Cellpose 等模型的结构
基于深度学习的细…
U-Net
07
重叠与粘连细胞分离
目标=距离变换 · 分水岭 · 凹点检测
重叠
粘连细胞分离
08
细胞形态特征提取
目标=面积 · 周长 · 圆形度
细胞形态特征提取
目标=面积
09
细胞核与细胞质形态分析
目标=核质比 · 核形态 · 染色质纹理
细胞核
细胞质形态分析
10
细胞骨架与亚细胞结构形态分析
目标=微管 · 肌动蛋白 · 线粒体等结构的图像分割
细胞骨架
亚细胞结构形态分…
11
细胞追踪与动态形态分析
目标=时间序列成像中的细胞检测 · 关联 · 轨迹构建与运动形态参数提取
细胞追踪
动态形态分析
12
细胞群体形态统计分析
目标=单细胞特征矩阵构建 · 分布分析 · 聚类
细胞群体形态统计…
目标=单细胞特征…
13
形态学表型分类与识别
目标=基于传统机器学习与深度学习的细… · 特征选择与模型评估
形态学表型分类
识别
14
药物处理下的细胞形态响应分析
目标=给药前后形态变化检测 · 剂量效应曲线 · 表型指纹构建与案例实战
药物处理下的细胞…
目标=给药前后形…
15
细胞形态学成像分析中的深度学习进阶
目标=自监督学习 · 域适应 · 少样本学习在形态分析中的应用
细胞形态学成像分…
深度学习进阶
16
3D 细胞形态成像与分析
目标=共聚焦 Z 栈采集 · 3D 分割 · 表面重建
3D
细胞形态成像
17
活细胞成像与形态动力学
目标=长时间活细胞成像的漂移校正 · 光毒性控制 · 动态形态事件检测
活细胞成像
形态动力学
18
高内涵筛选中的形态学分析工程
目标=多孔板成像 · 批量处理 · 孔间校正
高内涵筛选
形态学分析工程
19
细胞形态学成像分析流程自动化
目标=Pipeline 设计 · 任务调度 · 并行计算
细胞形态学成像分…
Pipeline
20
图像数据管理与元数据工程
目标=数据组织 · 命名规范 · 数据库
图像数据管理
元数据工程
21
细胞形态分析中的质量控制与误差分析
目标=分割精度评估 · 特征稳定性 · 批次效应
细胞形态分析
质量控制
22
细胞形态学成像分析的可视化与报告
目标=交互式可视化 · 形态图谱 · 统计图表
细胞形态学成像分…
报告
23
基于形态学的细胞状态识别案例
目标=凋亡 · 坏死 · 自噬
基于形态学的细胞…
目标=凋亡
24
免疫细胞形态与功能成像分析
目标=中性粒细胞 · 巨噬细胞 · T 细胞等的形态极化
免疫细胞形态
功能成像分析
25
肿瘤细胞形态异质性与侵袭分析
目标=肿瘤细胞形态多样性 · 上皮间质转化 · 侵袭伪足与迁移能力量化
肿瘤细胞形态异质…
侵袭分析
26
干细胞与分化形态学分析
目标=克隆形态 · 分化标志 · 集落形成
干细胞
分化形态学分析
27
类器官与 3D 细胞模型形态分析
目标=类器官分割 · 形态复杂度 · 出芽
类器官
3D
28
细胞形态学成像分析中的多模态融合
目标=荧光 · 明场 · 相差
细胞形态学成像分…
多模态融合
29
工程化部署与云端分析
目标=模型压缩 · 推理加速 · 边缘计算
工程化部署
云端分析
30
课程综合项目与前沿展望
目标=完整细胞形态学成像分析项目设计 · 实施 · 评估
课程综合项目
前沿展望
所属VIP或分类
同VIP:免疫荧光多通道成像工程
同VIP:共聚焦显微成像实验工程
同VIP:多色流式实验设计与补偿工程