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显微图像定量分析工程

共计 30 章节
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01
显微图像定量分析工程导论
目标=课程定位 · 核心任务 · 典型应用场景与完整工程流程概览
显微图像定量分析…目标=课程定位
02
显微成像物理基础与图像形成
目标=光学分辨率 · 点扩散函数 · 采样定理
显微成像物理基础图像形成
03
显微图像数据管理
目标=文件格式 · 元数据 · 多维数据组织
显微图像数据管理目标=文件格式
04
图像预处理工程
目标=去噪 · 背景校正 · 光照不均校正
图像预处理工程目标=去噪
05
图像增强与可视化
目标=对比度调整 · 伪彩色 · 投影与三维渲染在定量分析中的正确使用…
图像增强可视化
06
图像分割基础
目标=阈值法 · 边缘检测 · 区域生长
图像分割基础目标=阈值法
07
基于形态学的分割与后处理
目标=腐蚀 · 膨胀 · 开闭运算
基于形态学的分割后处理
08
基于机器学习的分割
目标=特征工程 · 随机森林 · 支持向量机在细胞与亚细胞结构分割中的…
基于机器学习的分…目标=特征工程
09
基于深度学习的分割
目标=U-Net · Mask R-CNN · Transformer 分割模型及显…
基于深度学习的分…U-Net
10
分割质量评估
目标=交并比 · Dice 系数 · 边界误差
分割质量评估目标=交并比
11
对象检测与定位
目标=斑点检测 · 模板匹配 · 连通域分析
对象检测定位
12
颗粒与细胞计数工程
目标=重叠对象拆分 · 计数校正 · 统计误差评估与自动化计数流程搭建
颗粒细胞计数工程
13
形态学定量分析
目标=面积 · 周长 · 圆度
形态学定量分析目标=面积
14
荧光强度定量分析
目标=光漂白校正 · 背景扣除 · 共定位分析
荧光强度定量分析目标=光漂白校正
15
纹理与图案定量分析
目标=灰度共生矩阵 · 局部二值模式 · 小波纹理与细胞纹理表型分析
纹理图案定量分析
16
空间分布与共定位分析
目标=最近邻距离 · Ripley K 函数 · 空间聚类
空间分布共定位分析
17
三维显微图像定量分析
目标=共聚焦与光片数据 · 三维分割 · 体素形态测量与三维可视化
三维显微图像定量…目标=共聚焦
18
时间序列显微图像分析
目标=活细胞追踪 · 运动分析 · 荧光强度动态曲线与事件检测
时间序列显微图像…目标=活细胞追踪
19
多通道与多模态图像配准
目标=刚性/非刚性配准 · 通道对齐 · 跨模态融合与配准误差评估
多通道多模态图像配准
20
显微图像定量分析中的统计方法
目标=实验设计 · 样本量估计 · 假设检验
显微图像定量分析统计方法
21
机器学习与深度学习进阶
目标=自监督学习 · 迁移学习 · 域适应与显微图像中的小样本问题
机器学习深度学习进阶
22
定量分析流程自动化
目标=脚本化处理 · 工作流引擎 · 批处理
定量分析流程自动…目标=脚本化处理
23
显微图像分析软件与工具链
目标=ImageJ/Fiji · CellProfiler · ilastik
显微图像分析软件工具链
24
可复现性与质量控制
目标=分析协议记录 · 参数溯源 · 盲法分析
可复现性质量控制
25
误差分析与不确定性量化
目标=分割误差传播 · 测量不确定度 · 灵敏度分析与鲁棒性测试
误差分析不确定性量化
26
高内涵筛选与表型分析
目标=多孔板成像 · 细胞表型提取 · 数据归一化与命中判定
高内涵筛选表型分析
27
病理与临床显微图像定量
目标=免疫组化评分 · 数字病理 · 肿瘤微环境定量与临床验证要点
病理临床显微图像定量
28
超分辨率与单分子定位定量
目标=定位精度 · 分子计数 · 聚类分析与超分辨数据定量挑战
超分辨率单分子定位定量
29
工程实战项目一
目标=从原始图像到统计报告的完整定量…
工程实战项目一目标=从原始图像…
30
工程实战项目二
目标=复杂生物样本的多通道三维时序图… · 结果解读与报告撰写
工程实战项目二目标=复杂生物样…