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《蛋白质组样本前处理工程》
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蛋白质组样本前处理工程
共计 30 章节
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01
蛋白质组样本前处理工程导论
目标=课程定位 · 前处理在蛋白质组学中的工程地位 · 核心目标与质量维度
蛋白质组样本前处…
目标=课程定位
02
样本采集与实验设计
目标=样本类型选择 · 生物学重复与技术重复 · 随机化与批次设计
样本采集
实验设计
03
样本保存与运输工程
目标=低温链管理 · 冻融循环影响 · 保存液与稳定剂选择
样本保存
运输工程
04
样本裂解与蛋白提取
目标=裂解液配方设计 · 机械与化学裂解方法 · 去污剂选择
样本裂解
蛋白提取
05
蛋白质定量与样本归一化
目标=BCA · Bradford · 紫外法等定量方法比较
蛋白质定量
样本归一化
06
去污剂去除与缓冲液置换
目标=透析 · 沉淀 · 固相萃取
去污剂去除
缓冲液置换
07
还原与烷基化工程
目标=二硫键还原剂选择 · 烷基化试剂比较 · 反应条件优化
还原
烷基化工程
08
蛋白酶解策略设计
目标=胰蛋白酶 · Lys-C等酶选择 · 酶与底物比例
蛋白酶解策略设计
目标=胰蛋白酶
09
溶液内酶解与FASP
目标=溶液内酶解流程 · FASP原理与操作 · 滤膜选择
FASP
溶液内酶解
10
凝胶内酶解与SDS-PAGE前处理
目标=胶内酶解步骤 · 脱色与还原烷基化 · 肽提取效率
SDS-PAGE
凝胶内酶解
11
SP3与磁珠辅助前处理
目标=SP3原理 · 磁珠选择与操作 · 结合与洗脱条件
SP3
磁珠辅助前处理
12
S-Trap与新型前处理技术
目标=S-Trap原理与操作 · 与FASP和SP3对比 · 适用样本类型
S-Trap
新型前处理技术
13
肽段脱盐与净化
目标=C18 · StageTip · 固相萃取柱
肽段脱盐
净化
14
肽段分级与预分离
目标=高pH反相 · 强阳离子交换 · 等电聚焦
肽段分级
预分离
15
低丰度蛋白与翻译后修饰样本前处理
目标=磷酸化 · 糖基化等修饰肽富集 · 低丰度蛋白富集策略
低丰度蛋白
翻译后修饰样本前…
16
微量与单细胞样本前处理
目标=微量样本挑战 · 低吸附耗材 · 纳升反应体系
微量
单细胞样本前处理
17
组织样本前处理工程
目标=组织匀浆 · 细胞分离 · 激光显微切割
组织样本前处理工…
目标=组织匀浆
18
血液与体液样本前处理
目标=血浆 · 血清 · 尿液
血液
体液样本前处理
19
细胞样本前处理工程
目标=贴壁与悬浮细胞收集 · 裂解 · 清洗
细胞样本前处理工…
目标=贴壁
20
植物与微生物样本前处理
目标=细胞壁破碎 · 多酚与多糖干扰去除 · 蛋白提取与酶解特殊策略
植物
微生物样本前处理
21
前处理中的污染物与干扰控制
目标=角蛋白 · 聚合物 · 去污剂
前处理
污染物
22
前处理自动化与高通量工程
目标=自动化液体处理平台 · 机器人工作站 · 微流控芯片
前处理自动化
高通量工程
23
前处理质量控制与评估
目标=过程空白 · 质控样本 · 肽段产率
前处理质量控制
评估
24
前处理与质谱兼容性工程
目标=缓冲液兼容性 · 去污剂与盐影响 · 肽段上样要求
前处理
质谱兼容性工程
25
前处理数据记录与实验室信息管理
目标=样本追踪 · 实验记录 · 元数据采集
前处理数据记录
实验室信息管理
26
前处理失败案例分析与故障排除
目标=常见失败模式 · 酶解不完全 · 肽损失
前处理失败案例分…
故障排除
27
前处理方案开发与优化实战
目标=从样本到肽段的方案设计 · 实验设计 · 条件筛选
前处理方案开发
优化实战
28
临床蛋白质组样本前处理规范
目标=伦理与合规 · 临床样本特殊要求 · 标准化操作流程
临床蛋白质组样本…
目标=伦理
29
前处理工程中的成本、时间与规模权衡
目标=试剂成本 · 时间效率 · 通量扩展
前处理工程
成本
30
前处理工程前沿与未来方向
目标=新型材料 · 微流控 · 单细胞
前处理工程前沿
未来方向
所属VIP或分类
同VIP:LC-MS质谱实验平台工程
同VIP:代谢组样本制备与检测工程
同VIP:多组学实验样本质量控制