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基因合成与序列优化工程

共计 30 章节
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01
基因合成与序列优化工程导论
目标=课程目标 · 技术范畴 · 工程流程与典型应用场景
基因合成序列优化工程导论
02
DNA合成化学与酶学基础
目标=亚磷酰胺化学 · 聚合酶链组装 · 连接酶与核酸酶工具
DNA合成化学
03
寡核苷酸设计与合成质量控制
目标=长度 · Tm · 二级结构
寡核苷酸设计合成质量控制
04
基因组装策略选择
目标=Gibson · Golden Gate · SLIC
基因组装策略选择Gibson
05
从寡核苷酸池到全长基因
目标=分级组装 · 纠错策略 · 克隆载体选择与验证方案
从寡核苷酸池到全…目标=分级组装
06
合成基因的宿主适配
目标=密码子使用频率 · tRNA丰度 · GC含量与mRNA结构对表达的影响
合成基因的宿主适…目标=密码子使用…
07
密码子优化算法与工具
目标=CAI · tAI · Codon Adaptation I…
密码子优化算法工具
08
序列级调控元件工程
目标=启动子 · RBS · 终止子
序列级调控元件工…目标=启动子
09
mRNA二级结构与翻译效率优化
目标=5'UTR · CDS边界 · 最小自由能计算与实验验证
mRNA二级结构
10
重复序列与复杂序列的合成策略
目标=串联重复 · 发夹结构 · 高GC/AT区的拆分与组装
重复序列复杂序列的合成策…
11
基因合成中的脱靶与错误控制
目标=错配修复 · NGS质控 · 错误率评估与纠错流程
基因合成脱靶
12
合成基因的克隆与体内组装
目标=限制性酶切 · 同源重组 · CRISPR辅助组装与筛选标记
合成基因的克隆体内组装
13
无细胞基因合成与体外表达
目标=TX-TL体系 · 模板设计 · 能量再生与表达优化
无细胞基因合成体外表达
14
基因组编辑与合成基因整合
目标=CRISPR/Cas9 · 同源定向修复 · 转座子与定点整合策略
基因组编辑合成基因整合
15
代谢通路基因簇的合成与优化
目标=多基因协调表达 · 启动子库 · RBS库与途径通量平衡
代谢通路基因簇的…优化
16
蛋白质工程中的序列优化
目标=定向进化 · 理性设计 · 突变库构建与高通量筛选
蛋白质工程序列优化
17
合成基因的稳定性与进化
目标=突变率控制 · 抗噬菌体防御 · 基因组最小化与稳健性设计
合成基因的稳定性进化
18
DNA存储与信息编码
目标=序列编码方案 · 纠错码 · 随机访问与合成成本权衡
DNA存储
19
基因合成中的生物安全与伦理
目标=筛查 · 管控 · 双用途研究与合规要求
基因合成生物安全
20
序列优化中的机器学习方法
目标=特征工程 · 深度学习模型 · 生成模型与预测性能评估
序列优化机器学习方法
21
高通量基因合成与自动化平台
目标=微流控 · 芯片合成 · 液体处理机器人与实验设计
高通量基因合成自动化平台
22
合成基因的检测与表征
目标=Sanger · NGS · 长读长测序
合成基因的检测表征
23
工业酶基因的合成与优化实战
目标=案例选择 · 密码子优化 · 表达宿主适配与发酵验证
工业酶基因的合成优化实战
24
疫苗与治疗性蛋白的基因合成
目标=抗原设计 · 载体优化 · 表达系统选择与质控
疫苗治疗性蛋白的基因…
25
植物与农业基因合成应用
目标=叶绿体转化 · 抗虫抗病基因 · 调控元件与田间评估
植物农业基因合成应用
26
合成基因组学与最小基因组
目标=支原体基因组合成 · Sc2.0 · 基因组重编码与伦理讨论
合成基因组学最小基因组
27
基因线路与合成生物学中的序列设计
目标=逻辑门 · 振荡器 · 反馈回路与鲁棒性优化
基因线路合成生物学
28
序列优化中的多目标权衡
目标=表达量 · 稳定性 · 免疫原性
序列优化多目标权衡
29
基因合成项目全流程管理
目标=需求分析 · 设计评审 · 外包选择
基因合成项目全流…目标=需求分析
30
前沿进展与未来方向
目标=酶促合成 · 长片段组装 · AI驱动设计
前沿进展未来方向