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生物信息学与 AI 制药工程
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049-蛋白质组学特征学习任务
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《质谱数据质量控制与异常检测方法》
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质谱数据质量控制与异常检测方法
共计 30 章节
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01
质谱数据基础
质谱原理 · 数据类型 · 常见格式(mzXML
质谱数据基础
质谱原理
02
质谱数据预处理流程
基线校正 · 噪声平滑 · 峰检测
质谱数据预处理流…
基线校正
03
质量控制概述
重要性 · 常用指标(信噪比 · 峰宽
质量控制概述
重要性
04
数据完整性检查
缺失值检测 · 扫描一致性
数据完整性检查
缺失值检测
05
强度校准与归一化
内标归一化 · 总和归一化
强度校准
归一化
06
质量轴校准与偏移检测
锁定质量 · 质量漂移校正
质量轴校准
偏移检测
07
峰检测质量评估
峰形对称性 · 分辨率
峰检测质量评估
峰形对称性
08
色谱对齐质量评估
保留时间漂移 · 对齐误差
色谱对齐质量评估
保留时间漂移
09
批次效应检测与校正
PCA · ComBat等方法
批次效应检测
校正
10
重复性与重现性评估
CV计算 · 相关系数
重复性
重现性评估
11
异常值初筛
基于统计的离群点检测(Z-score · IQR)
异常值初筛
Z-score
12
基于聚类的异常检测
DBSCAN · LOF
基于聚类的异常检…
DBSCAN
13
基于孤立森林的异常检测
iForest原理与应用
基于孤立森林的异…
iForest
14
基于自编码器的异常检测
AE · VAE在质谱中的应用
基于自编码器的异…
AE
15
基于GAN的异常检测
对抗生成网络用于异常检测
GAN
基于
16
时间序列异常检测
动态时间规整 · ARIMA
时间序列异常检测
动态时间规整
17
多变量异常检测
马氏距离 · Hotelling T2
多变量异常检测
马氏距离
18
质控样本与空白样本分析
QC样本的聚类与漂移
质控样本
空白样本分析
19
缺失值处理策略
插补方法(KNN · MICE)
缺失值处理策略
KNN
20
噪声与基线异常检测
形态学方法 · 小波变换
噪声
基线异常检测
21
峰检测异常
假阳性/假阴性识别
峰检测异常
假阳性
22
同位素模式异常检测
同位素分布一致性
同位素模式异常检…
同位素分布一致性
23
加合物与碎片异常检测
常见加合物识别
加合物
碎片异常检测
24
质量偏移异常检测
结合参考物质
质量偏移异常检测
结合参考物质
25
强度异常检测
动态范围 · 饱和效应
强度异常检测
动态范围
26
交互式质控可视化
控制图 · 箱线图 · 热图
交互式质控可视化
控制图
27
自动化质控流水线构建
Snakemake · Nextflow
自动化质控流水线…
Snakemake
28
案例1
蛋白质组学质控与异常检测
案例1
蛋白质组学质控
29
案例2
代谢组学质控与异常检测
案例2
代谢组学质控
30
总结与展望
质控发展趋势 · AI赋能
质控发展趋势
AI
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