VIP20
本课程属于：049-蛋白质组学特征学习任务 生物信息学与 AI 制药工程 · 共 20 门相关课程，组合学习更完整。
查看所属VIP全部课程 →
← 返回所属目录 咨询 / 购买

从质谱数据构建机器学习特征指南

共计 30 章节
点击此处阅读海量试读课程：100+行业、1000+细分领域
01
质谱数据基础
质谱原理 · 数据类型 · 常见格式（mzML
质谱数据基础质谱原理
02
质谱数据读取与解析
使用Python库（pyOpenMS · pymzML）读取质谱数据
质谱数据读取Python
03
原始质谱数据可视化
绘制谱图 · 基峰图 · 总离子流图
原始质谱数据可视…绘制谱图
04
质谱数据预处理
基线校正 · 平滑 · 峰检测基础
质谱数据预处理基线校正
05
峰检测算法
阈值法 · 小波变换 · 连续小波变换（CWT）
峰检测算法阈值法
06
峰对齐
保留时间对齐方法（动态时间规整DTW · 基于特征的对齐）
峰对齐DTW
07
峰定量
峰面积 · 峰高 · 信噪比计算
峰定量峰面积
08
数据归一化
内标归一化 · 总离子流归一化 · 分位数归一化
数据归一化内标归一化
09
缺失值处理
质谱数据中的缺失值及填充策略
缺失值处理质谱数据
10
特征提取概述
从原始数据到特征矩阵的流程
特征提取概述从原始数据到特征…
11
常见特征类型
m/z特征 · 保留时间特征 · 同位素峰特征
常见特征类型m/z
12
基于峰的特征
峰表构建 · 重复性评估
基于峰的特征峰表构建
13
基于分箱的特征
m/z分箱 · 保留时间分箱
基于分箱的特征m/z
14
基于卷积的特征
使用滑动窗口提取局部特征
基于卷积的特征使用滑动窗口提取…
15
质谱谱图相似性度量
点积 · 余弦相似度 · 相关相似度
质谱谱图相似性度…点积
16
特征选择基础
方差过滤 · 相关系数 · 互信息
特征选择基础方差过滤
17
降维方法
PCA · t-SNE · UMAP在质谱特征中的应用
降维方法PCA
18
特征重要性评估
随机森林 · XGBoost特征重要性
特征重要性评估随机森林
19
分类特征构建
从质谱数据到分类标签
分类特征构建从质谱数据到分类…
20
回归特征构建
定量分析中的特征工程
回归特征构建定量分析
21
时间序列质谱特征
动态监测数据的特征提取
时间序列质谱特征动态监测数据的特…
22
同位素模式特征
自然丰度校正 · 同位素标记实验
同位素模式特征自然丰度校正
23
碎片谱图特征
MS/MS谱图的特征提取
碎片谱图特征MS/MS
24
质谱数据增强
模拟噪声 · 扰动生成更多样本
质谱数据增强模拟噪声
25
特征标准化与缩放
Z-score · MinMaxScaler
特征标准化缩放
26
特征组合与交互
多项式特征 · 交叉积
特征组合交互
27
基于深度学习的自动特征学习
Autoencoder提取特征
基于深度学习的自…Autoencoder
28
特征评估指标
区分度 · 稳定性 · 可解释性
特征评估指标区分度
29
实战项目
从头构建一个质谱分类模型
实战项目从头构建一个质谱…
30
课程总结与进阶方向
最新工具 · 文献推荐
课程总结进阶方向