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生物信息学与 AI 制药工程
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045-AI药物发现特征学习任务
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《R语言特征提取与建模分析》
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R语言特征提取与建模分析
共计 30 章节
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01
R语言概述
R语言特点 · RStudio安装与配置 · R包管理
R语言概述
R语言特点
02
R语言数据结构
向量 · 矩阵 · 数组
R语言数据结构
向量
03
数据导入与导出
readr和readxl包读取CSV · Excel · 文本文件
数据导入
导出
04
数据探索基础
summary · str · head
数据探索基础
summary
05
tidyverse入门
dplyr和tidyr核心函数sel… · filter · mutate
tidyverse
dplyr
06
缺失值处理
识别缺失值 · 删除 · 填充(均值
缺失值处理
识别缺失值
07
异常值处理
箱线图 · Z-score · IQR方法
异常值处理
箱线图
08
数据标准化与归一化
scale函数 · caret::preProcess · 自定义函数
数据标准化
归一化
09
连续变量离散化
cut函数 · 分箱(等宽 · 等频)
连续变量离散化
cut
10
独热编码
dummyVars · recipes · 手动实现
独热编码
dummyVars
11
标签编码与因子变量
factor · forcats包 · 有序因子
标签编码
因子变量
12
特征构建
多项式特征 · 交互特征 · domain知识特征
特征构建
多项式特征
13
文本特征提取
stringr包 · 正则表达式 · 词频统计
文本特征提取
stringr
14
日期时间特征
lubridate包 · 提取年/月/日/星期 · 时间差
日期时间特征
lubridate
15
数值变换
对数变换 · Box-Cox变换 · Yeo-Johnson变换
数值变换
对数变换
16
降维
PCA(prcomp) · t-SNE · UMAP
降维
PCA
17
特征选择
相关性分析 · 卡方检验 · 信息增益
特征选择
相关性分析
18
递归特征消除(RFE)
caret::rfe · 特征选择性能评估
RFE
递归特征消除
19
LASSO回归特征选择
glmnet包 · lambda路径 · 非零系数特征
LASSO
回归特征选择
20
过滤式特征选择
方差阈值 · 相关系数筛选
过滤式特征选择
方差阈值
21
包裹式特征选择
模拟退火 · 遗传算法
包裹式特征选择
模拟退火
22
嵌入式特征选择
决策树 · 随机森林 · XGBoost特征重要性
嵌入式特征选择
决策树
23
特征重要性可视化
dotchart · ggplot2条形图 · shap值
特征重要性可视化
dotchart
24
交互特征检测
H2O自动交互 · 决策树规则
交互特征检测
H2O
25
数据采样与不平衡处理
SMOTE · 欠采样 · 过采样
数据采样
不平衡处理
26
时间序列特征工程
滞后特征 · 滚动统计 · 差分
时间序列特征工程
滞后特征
27
图像特征工程
magick包基本特征提取
图像特征工程
magick
28
管道化特征工程
recipes包创建管道 · prep+bake · workflows
管道化特征工程
recipes
29
自定义特征工程函数
purrr批量处理 · 编写通用函数
自定义特征工程函…
purrr
30
特征工程实战案例
Kaggle数据集完整流程
特征工程实战案例
Kaggle
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