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生物信息学与 AI 制药工程
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《集群队列管理与CPU监控实战》
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集群队列管理与CPU监控实战
共计 30 章节
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01
集群队列管理概述
什么是作业调度系统 · 常见的调度器对比(SLURM · PBS
集群队列管理概述
什么是作业调度系…
02
Linux基础回顾
必要的Shell命令 · 文件权限 · 环境变量
Linux
基础回顾
03
SLURM架构与安装
SLURM组件(slurmctld · slurmd · sacctmgr等)
SLURM
架构
04
SLURM基本配置
slurm.conf关键参数(Con… · Partitions · Nodes
SLURM
基本配置
05
SLURM作业提交基础
sbatch参数详解(--job-n… · --output · --ntasks
SLURM
作业提交基础
06
SLURM交互式作业
srun用法 · 交互式分配节点 · x11转发
SLURM
交互式作业
07
作业队列管理
squeue查看队列 · scancel取消作业 · scontrol修改作业属性
作业队列管理
squeue
08
作业依赖与数组作业
--dependency=after… · afternotok · 作业数组(--array)
作业依赖
数组作业
09
SLURM资源限制与QoS
用户/组配额 · AccountingStorageT… · QoS定义与优先级
SLURM
QoS
10
SLURM记账与统计
sacct查看历史作业 · sacctmgr管理用户/账户 · 作业能耗统计
SLURM
记账
11
SLURM高级特性
作业抢占(PreemptType) · 异构作业(--heterogeneo… · 多节点作业MPI环境配置
SLURM
高级特性
12
集群性能监控总览
监控的重要指标(CPU · 内存 · 网络
集群性能监控总览
CPU
13
Linux CPU基础知识
CPU架构(NUMA · 超线程) · 频率与功耗
Linux
CPU
14
top命令深度剖析
top交互操作 · 字段含义(%CPU · %MEM
top
命令深度剖析
15
htop与atop
htop彩色显示 · 树形进程 · F6排序
htop
atop
16
mpstat与sar
mpstat查看单核/整体CPU使用… · sar收集历史数据(-u · -r
mpstat
sar
17
pidstat与perf
pidstat按进程统计CPU/内存 · perf stat/perf rec… · 性能热点定位
pidstat
perf
18
lscpu与/proc/cpuinfo
查看CPU型号 · 核心数 · 频率
lscpu
proc/cpuinfo
19
内存与Swap监控
free · vmstat · /proc/meminfo
Swap
内存
20
磁盘I/O监控
iostat · iotop · dstat
I/O
磁盘
21
网络监控基础
ifstat · nethogs · ss/tcpdump
网络监控基础
ifstat
22
GPU监控(NVIDIA)
nvidia-smi实时监控 · nvidia-smi dmon · nvidia-smi pmon
GPU
NVIDIA
23
集群级监控方案Prometheus + Node Exporter
架构介绍 · 部署node_exporter · Prometheus配置scrape
Prometheus
Node
24
SLURM与监控集成
slurm-exporter导出作业… · 用Grafana展示集群负载与作业排…
SLURM
监控集成
25
报警规则与通知
Prometheus Alertma… · 触发条件(节点宕机 · CPU过载
报警规则
通知
26
集群作业性能分析
使用perf stat分析作业的指令… · 缓存命中率 · 分支预测
集群作业性能分析
perf
27
CPU绑定与优化实战
taskset设置亲和性 · numactl控制内存分配策略 · MKL/OpenBLAS多线程调优
CPU
绑定
28
集群日常运维脚本
自动清理僵尸作业 · 检查节点健康 · 重启slurmd
集群日常运维脚本
自动清理僵尸作业
29
故障排查实战
节点DOWN排查(slurmd日志 · munge认证 · 防火墙)
故障排查实战
DOWN
30
课程总结与最佳实践
从集群规划到监控闭环 · 常见陷阱 · 资源预留策略
课程总结
最佳实践
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