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SMILES序列预处理与分子数据增强

共计 30 章节
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01
SMILES简介与化学语言基础
SMILES简介与化学语言基础 · 核心概念 · 实践要点
SMILES简介
02
SMILES字符串的语法规则与常见错误
SMILES字符串的语法规则与常见错误 · 核心概念 · 实践要点
SMILES字符串的语法规则
03
SMILES的标准化（Canonicalization）原理与实现
SMILES的标准化（Canonical… · 核心概念 · 实践要点
SMILESCanonicaliza…
04
去除盐和溶剂分子（Desalting）操作
去除盐和溶剂分子（Desalting）操… · 核心概念 · 实践要点
Desalting去除盐
05
电荷中和与质子化状态调整方法
电荷中和与质子化状态调整方法 · 核心概念 · 实践要点
电荷质子化状态调整方…
06
分子结构的验证与自动修复
分子结构的验证与自动修复 · 核心概念 · 实践要点
分子结构的验证自动修复
07
无效SMILES过滤与清洗策略
无效SMILES过滤与清洗策略 · 核心概念 · 实践要点
SMILES无效
08
SMILES的标记化（Tokenization）技术
SMILES的标记化（Tokenizat… · 核心概念 · 实践要点
SMILESTokenization
09
分子指纹与SMILES之间的转换方法
分子指纹与SMILES之间的转换方法 · 核心概念 · 实践要点
SMILES分子指纹
10
序列长度归一化与填充处理
序列长度归一化与填充处理 · 核心概念 · 实践要点
序列长度归一化填充处理
11
数据清洗
重复条目 · 模糊匹配与异常值处理
数据清洗重复条目
12
训练/验证/测试集划分策略与注意事项
训练/验证/测试集划分策略与注意事项 · 核心概念 · 实践要点
训练验证
13
数据增强概述及其在化学信息学中的重要性
数据增强概述及其在化学信息学中的重要性 · 核心概念 · 实践要点
数据增强概述化学信息学
14
基于枚举的SMILES增强（Random SMILES）
基于枚举的SMILES增强（Random… · 核心概念 · 实践要点
SMILESRandom
15
原子与化学键的局部扰动增强
原子与化学键的局部扰动增强 · 核心概念 · 实践要点
原子化学键的局部扰动…
16
子结构替换与骨架跃迁增强
子结构替换与骨架跃迁增强 · 核心概念 · 实践要点
子结构替换骨架跃迁增强
17
分子片段重组与拼接增强
分子片段重组与拼接增强 · 核心概念 · 实践要点
分子片段重组拼接增强
18
基于变分自编码器（VAE）的分子增强
基于变分自编码器（VAE）的分子增强 · 核心概念 · 实践要点
VAE基于变分自编码器
19
基于生成对抗网络（GAN）的SMILES数据增强
基于生成对抗网络（GAN）的SMILES… · 核心概念 · 实践要点
GANSMILES
20
基于Transformer的分子序列生成增强
基于Transformer的分子序列生成… · 核心概念 · 实践要点
Transformer基于
21
序列到序列（Seq2Seq）翻译增强方法
序列到序列（Seq2Seq）翻译增强方法 · 核心概念 · 实践要点
Seq2Seq序列到序列
22
强化学习在数据增强中的应用
强化学习在数据增强中的应用 · 核心概念 · 实践要点
强化学习数据增强
23
数据增强的质量控制与验证指标
数据增强的质量控制与验证指标 · 核心概念 · 实践要点
数据增强的质量控…验证指标
24
预处理与增强在分子性质预测中的实践
预处理与增强在分子性质预测中的实践 · 核心概念 · 实践要点
预处理增强
25
预处理与增强在逆合成预测中的应用
预处理与增强在逆合成预测中的应用 · 核心概念 · 实践要点
预处理增强
26
预处理与增强在分子深度生成模型中的整合
预处理与增强在分子深度生成模型中的整合 · 核心概念 · 实践要点
预处理增强
27
常用工具与库
RDKit · ChemAxon · DeepChem等
常用工具RDKit
28
大规模数据处理性能优化与并行加速
大规模数据处理性能优化与并行加速 · 核心概念 · 实践要点
大规模数据处理性…并行加速
29
评估数据增强效果的实验设计方法
评估数据增强效果的实验设计方法 · 核心概念 · 实践要点
评估数据增强效果…重点
30
未来趋势与挑战
自监督学习 · 多模态融合等
未来趋势挑战