VIP20
本课程属于：020-SMILES分子生成建模 生物信息学与 AI 制药工程 · 共 20 门相关课程，组合学习更完整。
查看所属VIP全部课程 →
← 返回所属目录 咨询 / 购买

SMILES分子生成模型构建与效果评估

共计 30 章节
点击此处阅读海量试读课程：100+行业、1000+细分领域
01
SMILES简介
历史背景 · 表示规则 · 原子类型
SMILES简介
02
分子数据处理
使用RDKit读取 · 写入SMILES · 分子可视化
分子数据处理RDKit
03
分子描述符与指纹
基于SMILES计算分子描述符 · ECFP · MACCS等指纹
分子描述符指纹
04
传统分子生成方法
基于规则的生成 · 组合库设计 · SMILES枚举
传统分子生成方法基于规则的生成
05
深度学习基础
神经网络 · 反向传播 · 梯度下降
深度学习基础神经网络
06
序列模型与SMILES
RNN · LSTM · GRU用于SMILES序列建模
SMILES序列模型
07
数据预处理
SMILES分词 · 标记化 · one-hot编码
数据预处理SMILES
08
CharRNN模型
架构设计 · 训练过程 · 生成策略
CharRNN模型
09
Beam Search与采样
温度采样 · Top-k采样 · Beam Search在SMILES…
BeamSearch
10
分子生成评估指标
有效性 · 唯一性 · 新颖性
分子生成评估指标有效性
11
VAE用于分子生成
变分自编码器原理 · SMILES-VAE架构
VAE用于分子生成
12
GAN用于分子生成
生成对抗网络 · MolGAN及改进
GAN用于分子生成
13
Transformer与分子生成
Attention机制 · SMILES Transformer…
Transformer分子生成
14
强化学习优化分子生成
REINVENT框架 · 策略梯度 · 奖赏函数设计
强化学习优化分子…REINVENT
15
目标导向分子生成
多目标优化 · Pareto前沿 · 属性调节
目标导向分子生成多目标优化
16
分子生成中的约束
相似性约束 · 药效团约束 · 合成可及性约束
分子生成约束
17
基于图神经网络的分子生成
图表示 · GCN · GIN
基于图神经网络的…图表示
18
自回归模型
PixelCNN · WaveNet思想应用于分子生成
自回归模型PixelCNN
19
扩散模型与分子生成
DDPM · GeoLDM等最新方法
扩散模型分子生成
20
分子生成与逆合成分析
结合逆合成路径的生成策略
分子生成逆合成分析
21
条件分子生成
基于属性条件（LogP · QED · SA）的生成
条件分子生成LogP
22
片段与反应驱动的分子生成
利用反应模板 · BREED等
片段反应驱动的分子生…
23
分子生成中的迁移学习
预训练模型 · 微调策略
分子生成迁移学习
24
分子生成项目实战1
数据准备与预处理（ChEMBL · DrugBank）
分子生成项目实战…ChEMBL
25
分子生成项目实战2
构建CharRNN模型并训练
分子生成项目实战…CharRNN
26
分子生成项目实战3
生成与过滤 · 评估指标计算
分子生成项目实战…生成
27
分子生成项目实战4
使用强化学习优化属性
分子生成项目实战…使用强化学习优化…
28
分子生成项目实战5
部署为Web服务（Flask/Fas…
分子生成项目实战…Web
29
分子生成前沿综述
最新论文 · 开源工具（MoleculeKit · Reinvent等）
分子生成前沿综述最新论文
30
总结与展望
挑战 · 伦理问题 · 未来方向
挑战伦理问题