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SHAP解释ADMET预测结果与分子特征

共计 30 章节
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01
SHAP与ADMET概述
SHAP背景 · ADMET重要性 · 课程目标
SHAPADMET
02
SHAP理论基础
Shapley值 · 博弈论解释 · 加性特征归因
SHAP理论基础
03
ADMET预测简介
ADMET属性 · 机器学习预测常用方法 · 评估指标
ADMET预测简介
04
数据准备
分子描述符计算 · 标准化 · 数据集划分（训练/验证/测试）
数据准备分子描述符计算
05
常见分子表示
SMILES · 分子指纹 · 图神经网络
常见分子表示SMILES
06
模型选择
回归与分类模型 · 随机森林 · XGBoost
模型选择回归
07
模型训练与调优
交叉验证 · 超参数搜索 · 正则化
模型训练调优
08
模型评估
ROC-AUC · R² · MAE
模型评估ROC-AUC
09
SHAP理解
SHAP vs 其他解释方法（LIM… · PDP · ICE）
SHAP理解
10
SHAP值计算
TreeExplainer · KernelExplainer · DeepExplainer等
SHAP值计算
11
SHAP可视化基础
force plot · summary plot · dependence plot
SHAP可视化基础
12
SHAP force plot详解
单样本解释 · 模型输出分解 · 可视化解读
SHAPforce
13
SHAP summary plot
全局特征重要性 · 特征影响分布 · 颜色编码
SHAPsummary
14
SHAP dependence plot
单个特征影响 · 交互作用检测 · 部分依赖
SHAPdependence
15
SHAP交互作用分析
SHAP interaction v… · 热图 · 交互网络
SHAP交互作用分析
16
SHAP与ADMET案例分析1
水溶性预测（LogS）解释
SHAPADMET
17
SHAP与ADMET案例分析2
脂溶性预测（LogP）解释
SHAPADMET
18
SHAP与ADMET案例分析3
血浆蛋白结合率（PPB）解释
SHAPADMET
19
SHAP与ADMET案例分析4
血脑屏障通过性（BBB）预测解释
SHAPADMET
20
SHAP与ADMET案例分析5
hERG毒性预测与特征归因
SHAPADMET
21
SHAP与ADMET案例分析6
CYP450代谢位点预测解释
SHAPADMET
22
SHAP用于特征工程
基于SHAP的特征选择 · 冗余特征剔除
SHAP用于特征工程
23
SHAP用于模型调试
发现数据偏见 · 模型过拟合识别 · 异常样本
SHAP用于模型调试
24
SHAP与多任务模型
多任务ADMET预测 · 特征重要性对比
SHAP多任务模型
25
SHAP与分子生成
利用SHAP指导分子优化 · 生成可解释分子
SHAP分子生成
26
SHAP在药物发现流程中的应用
筛选 · 优化 · ADMET风险评估
SHAP药物发现流程
27
大规模SHAP计算
batch处理 · 加速技巧 · 内存优化
SHAP大规模
28
SHAP结果呈现与报告
生成HTML报告 · 交互式仪表盘
SHAP结果呈现
29
SHAP局限性讨论
近似误差 · 特征相关性 · 计算成本
SHAP局限性讨论
30
总结与未来方向
SHAP与深度学习可解释性 · 与AI制药展望
未来方向SHAP