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Conda与Docker组学计算环境复现

共计 30 章节
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01
课程概述
可重复计算的意义 · Conda和Docker的角色 · 课程目标与结构
课程概述可重复计算的意义
02
Conda简介
Conda是什么 · 与pip和virtualenv的对比 · 安装Conda（Miniconda/…
Conda简介
03
Conda环境管理
创建环境 · 激活/退出环境 · 列出环境
Conda环境管理
04
Conda包管理
安装包 · 卸载包 · 更新包
Conda包管理
05
环境导出与复制
conda env export · environment.yml文件 · 基于yml重建环境
环境导出复制
06
Python版本管理
使用conda创建不同Python版… · 切换默认Python
Python版本管理
07
Docker基础
容器与虚拟机的区别 · Docker架构 · 安装Docker（Linux/mac…
Docker容器
08
Docker基本操作
拉取镜像 · 运行容器 · 查看容器
Docker基本操作
09
Dockerfile编写
FROM · RUN · COPY
Dockerfile编写
10
Docker Compose
定义多服务应用 · docker-compose.yml… · 常用命令
DockerCompose
11
Conda与Docker的结合
为什么需要结合 · 直接在Docker镜像中安装cond… · 最佳实践
CondaDocker
12
构建带conda环境的Docker镜像
编写Dockerfile安装Mini… · 注意层优化
condaDocker
13
多阶段构建
使用多阶段构建减小镜像体积 · 分离构建环境与运行环境
多阶段构建使用多阶段构建减…
14
数据持久化
数据卷(volume)与绑定挂载(b… · 在容器中持久化conda环境
数据持久化volume
15
网络配置
端口映射 · 自定义网络 · 容器间DNS解析
网络配置端口映射
16
容器间通信
使用Docker网络连接多个容器 · 编排应用
容器间通信Docker
17
环境可重复性挑战
版本漂移 · 系统依赖 · GPU驱动等问题
环境可重复性挑战版本漂移
18
锁定conda环境
使用conda env export… · 显式指定依赖版本
conda锁定
19
锁定Docker镜像
使用具体镜像摘要（digest）或版… · 避免latest
Docker锁定
20
可重复构建工作流
从源代码到最终容器的可重复流水线设计 · 使用Makefile或脚本
可重复构建工作流从源代码到最终容…
21
自动化构建
编写Makefile或shell脚本…
自动化构建Makefile
22
CI/CD集成
在GitHub Actions/Gi…
CI/CD集成
23
测试可重复性
验证在不同时间或不同机器上重现相同环…
测试可重复性验证
24
部署到生产环境
使用docker部署可重复计算服务 · 环境一致性
部署到生产环境docker
25
跨平台构建
使用Docker buildx构建多… · arm64）
跨平台构建Docker
26
conda缓存优化
利用Docker层缓存和conda缓… · 加速构建
conda缓存优化
27
Docker层缓存策略
合理安排Dockerfile指令顺序 · 利用构建缓存
Docker层缓存策略
28
复杂依赖管理
处理conda和pip混用 · 系统库安装 · 使用apt和conda
复杂依赖管理conda
29
综合实战
构建一个可重复的数据分析流水线 · 包含Python环境 · 数据处理
综合实战构建一个可重复的…
30
回顾与最佳实践
课程要点总结 · 常见错误与建议 · 持续改进方向
回顾最佳实践