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QSAR药物靶点预测模型构建与部署

共计 30 章节
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01
QSAR概述
定量构效关系的发展史 · 核心概念 · 应用领域与经典案例
QSAR定量构效关系的发…
02
QSAR建模流程
从数据收集到模型部署的完整Pipel…
QSAR建模流程
03
分子结构表示基础
SMILES · InChI · 分子图与常用分子格式
分子结构表示基础SMILES
04
化合物数据获取
ChEMBL · PubChem · DrugBank等主流数据库的使用方…
化合物数据获取ChEMBL
05
数据预处理
缺失值处理 · 异常值检测 · 标准化与归一化
数据预处理缺失值处理
06
分子描述符计算（一）
理化性质描述符（LogP · MW · HBD
分子描述符计算LogP
07
分子描述符计算（二）
拓扑描述符 · 分子指纹（ECFP · MACCS等）
分子描述符计算拓扑描述符
08
分子描述符计算（三）
3D描述符 · 形状描述符 · 静电描述符
分子描述符计算3D描述符
09
特征选择方法
方差过滤 · 互信息 · 卡方检验
特征选择方法方差过滤
10
特征降维
PCA · t-SNE · UMAP原理与QSAR应用场景
特征降维PCA
11
数据集划分策略
随机划分 · 分层划分 · 基于分子支架的划分
数据集划分策略随机划分
12
传统QSAR建模（一）
多元线性回归（MLR）与偏最小二乘（…
QSAR传统
13
传统QSAR建模（二）
支持向量回归（SVR）与随机森林（R…
QSAR传统
14
传统QSAR建模（三）
梯度提升机（GBM · XGBoost · LightGBM）
QSAR传统
15
深度学习QSAR建模（一）
全连接神经网络（DNN）构建与调参
QSAR深度学习
16
深度学习QSAR建模（二）
图神经网络（GNN）用于分子学习
QSAR深度学习
17
深度学习QSAR建模（三）
注意力机制与Transformer在…
QSAR深度学习
18
模型验证与评估
交叉验证（K-fold · LOO） · 外部验证
模型验证评估
19
回归模型评价指标
R² · RMSE · MAE
回归模型评价指标R²
20
分类模型评价指标
AUC · 准确率 · 召回率
分类模型评价指标AUC
21
模型可解释性
SHAP值 · 特征重要性 · 局部依赖图（PDP）
模型可解释性SHAP
22
靶点预测基础
靶点蛋白类型 · 靶点数据库（UniProt · PDB）
靶点预测基础靶点蛋白类型
23
同源建模与分子对接概述
从靶点结构到配体结合模式
同源建模分子对接概述
24
基于配体的靶点预测
相似性搜索 · 药效团模型 · 联合QSAR
基于配体的靶点预…相似性搜索
25
基于结构的靶点预测
分子对接打分 · 虚拟筛选策略与QSAR集成
基于结构的靶点预…分子对接打分
26
多任务学习与多靶点预测
模型架构 · 数据增强与迁移学习
多任务学习多靶点预测
27
QSAR模型部署
Flask/Streamlit构建W… · API封装
QSAR模型部署
28
QSAR实战案例（一）
毒性预测——从数据到模型的完整流程
QSAR实战案例
29
QSAR实战案例（二）
溶解度预测——特征工程与模型对比
QSAR实战案例
30
QSAR前沿进展
自动机器学习（AutoML） · 联邦学习 · 多模态整合
QSAR前沿进展