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AI药物发现分子筛选与性质预测管线

共计 30 章节
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01
AI药物发现概述
药物发现流程 · AI的作用 · 常见挑战
AI药物发现概述
02
药物数据资源
公共数据库（ChEMBL · DrugBank · PubChem）的使用
药物数据资源ChEMBL
03
数据预处理与清洗
处理缺失值 · 标准化 · 过滤
数据预处理清洗
04
分子表示
SMILES · InChI · 分子指纹（Morgan
分子表示SMILES
05
分子图表示与图神经网络基础。
分子图表示与图神经网络基础 · 核心概念 · 实践要点
分子图表示图神经网络基础
06
分子性质预测模型
分类与回归
分子性质预测模型分类
07
虚拟筛选与分子对接简介。
虚拟筛选与分子对接简介 · 核心概念 · 实践要点
虚拟筛选分子对接简介
08
基于配体的虚拟筛选方法。
基于配体的虚拟筛选方法 · 核心概念 · 实践要点
基于配体的虚拟筛…重点
09
基于结构的虚拟筛选方法。
基于结构的虚拟筛选方法 · 核心概念 · 实践要点
基于结构的虚拟筛…重点
10
分子生成模型
变分自编码器（VAE）
分子生成模型VAE
11
分子生成模型
生成对抗网络（GAN）
分子生成模型GAN
12
分子生成模型
自回归模型（如Transformer…
分子生成模型Transformer
13
强化学习在分子优化中的应用。
强化学习在分子优化中的应用 · 核心概念 · 实践要点
强化学习分子优化
14
多目标优化与Pareto前沿。
多目标优化与Pareto前沿 · 核心概念 · 实践要点
Pareto多目标优化
15
蛋白质-配体相互作用预测。
蛋白质-配体相互作用预测 · 核心概念 · 实践要点
蛋白质配体相互作用预测
16
结合位点预测与分子对接。
结合位点预测与分子对接 · 核心概念 · 实践要点
结合位点预测分子对接
17
药代动力学性质预测（ADMET）。
药代动力学性质预测（ADMET） · 核心概念 · 实践要点
ADMET药代动力学性质预…
18
毒性预测模型。
毒性预测模型 · 核心概念 · 实践要点
毒性预测模型重点
19
合成可及性评估。
合成可及性评估 · 核心概念 · 实践要点
合成可性评估
20
数据增强与迁移学习。
数据增强与迁移学习 · 核心概念 · 实践要点
数据增强迁移学习
21
模型评估与验证策略。
模型评估与验证策略 · 核心概念 · 实践要点
模型评估验证策略
22
可解释性方法
注意力机制 · SHAP等
可解释性方法注意力机制
23
Pipeline构建工具
Snakemake / Nextfl…
Pipeline构建工具
24
工作流管理与Docker容器化。
工作流管理与Docker容器化 · 核心概念 · 实践要点
Docker工作流管理
25
云端部署与HPC集群。
云端部署与HPC集群 · 核心概念 · 实践要点
HPC云端部署
26
案例研究
从靶标发现到先导化合物
案例研究从靶标发现到先导…
27
案例研究
基于深度学习的虚拟筛选实战
案例研究基于深度学习的虚…
28
案例研究
分子生成与优化实战
案例研究分子生成
29
常见陷阱与最佳实践。
常见陷阱与最佳实践 · 核心概念 · 实践要点
常见陷阱最佳实践
30
未来趋势
生成式AI · 大语言模型在药物发现中的应用
未来趋势AI