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生物信息学与 AI 制药工程
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005-AI药物发现靶点筛选
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《图神经网络QSAR药物靶点发现建模》
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本课程属于:005-AI药物发现靶点筛选
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图神经网络QSAR药物靶点发现建模
共计 30 章节
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01
图神经网络概述与应用领域
图神经网络概述与应用领域 · 核心概念 · 实践要点
图神经网络概述
应用领域
02
图的基本概念与表示方法
图的基本概念与表示方法 · 核心概念 · 实践要点
图的基本概念
表示方法
03
消息传递框架与图卷积网络
消息传递框架与图卷积网络 · 核心概念 · 实践要点
消息传递框架
图卷积网络
04
图注意力网络与多头注意力
图注意力网络与多头注意力 · 核心概念 · 实践要点
图注意力网络
多头注意力
05
图同构网络与池化操作
图同构网络与池化操作 · 核心概念 · 实践要点
图同构网络
池化操作
06
图神经网络的正则化与训练技巧
图神经网络的正则化与训练技巧 · 核心概念 · 实践要点
图神经网络的正则…
训练技巧
07
QSAR基础
分子描述符与指纹
QSAR
分子描述符
08
定量构效关系建模流程
定量构效关系建模流程 · 核心概念 · 实践要点
定量构效关系建模…
重点
09
分子表示学习
SMILES与分子图
分子表示学习
SMILES
10
分子图的特征工程
原子特征与键特征
分子图的特征工程
原子特征
11
RDKit工具入门与分子操作
RDKit工具入门与分子操作 · 核心概念 · 实践要点
RDKit
工具入门
12
PyTorch Geometric基础与数据加载
PyTorch Geometric基础与… · 核心概念 · 实践要点
PyTorch
Geometric
13
图神经网络用于分子性质预测
图神经网络用于分子性质预测 · 核心概念 · 实践要点
图神经网络用于分…
重点
14
多任务学习与分子属性预测
多任务学习与分子属性预测 · 核心概念 · 实践要点
多任务学习
分子属性预测
15
分子生成与图生成模型
分子生成与图生成模型 · 核心概念 · 实践要点
分子生成
图生成模型
16
蛋白质-配体相互作用的图表示
蛋白质-配体相互作用的图表示 · 核心概念 · 实践要点
蛋白质
配体相互作用的图…
17
分子对接与打分函数
分子对接与打分函数 · 核心概念 · 实践要点
分子对接
打分函数
18
基于图的蛋白质结构预测
基于图的蛋白质结构预测 · 核心概念 · 实践要点
基于图的蛋白质结…
重点
19
靶点识别与药物重定位
靶点识别与药物重定位 · 核心概念 · 实践要点
靶点识别
药物重定位
20
图神经网络在ADMET预测中的应用
图神经网络在ADMET预测中的应用 · 核心概念 · 实践要点
ADMET
图神经网络
21
解释性图神经网络
注意力权重与子图提取
解释性图神经网络
注意力权重
22
图对比学习在分子表征中的应用
图对比学习在分子表征中的应用 · 核心概念 · 实践要点
图对比学习
分子表征
23
分子图的自监督预训练
分子图的自监督预训练 · 核心概念 · 实践要点
分子图的自监督预…
重点
24
大规模分子图的高效训练
大规模分子图的高效训练 · 核心概念 · 实践要点
大规模分子图的高…
重点
25
基于图的药物-靶标相互作用预测
基于图的药物-靶标相互作用预测 · 核心概念 · 实践要点
基于图的药物
靶标相互作用预测
26
图神经网络与分子动力学模拟结合
图神经网络与分子动力学模拟结合 · 核心概念 · 实践要点
图神经网络
分子动力学模拟结…
27
Graph Neural Networks for Drug Discovery
Graph Neural Network… · 核心概念 · 实践要点
Graph
Neural
28
常用数据集
MoleculeNet · PDBBind · Tox21等
常用数据集
MoleculeNet
29
项目实战
构建一个QSAR预测模型
项目实战
QSAR
30
课程总结与未来方向
课程总结与未来方向 · 核心概念 · 实践要点
课程总结
未来方向
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