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013-数字病理与影像组学工程
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《WSI病理图像分割与定量分析》
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本课程属于:013-数字病理与影像组学工程
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WSI病理图像分割与定量分析
共计 30 章节
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01
WSI基础与格式解析
目标=全切片图像的定义 · 成像原理 · 常见格式(SVS
WSI
格式解析
02
病理图像颜色与视觉特征
目标=H&E染色原理 · 颜色空间(RGB · HSV
病理图像颜色
视觉特征
03
WSI预处理与组织区域检测
目标=背景去除 · 组织掩膜生成 · Otsu阈值与形态学操作
WSI
预处理
04
切片级与图块级处理策略
目标=金字塔层级选择 · 图块(patch)提取 · 重叠与步长设计
切片级
图块级处理策略
05
病理图像分割任务概述
目标=语义分割 · 实例分割 · 全景分割在WSI中的定义与区别
病理图像分割任务…
目标=语义分割
06
基于传统方法的WSI分割
目标=阈值分割 · 区域生长 · 分水岭
WSI
基于传统方法的
07
深度学习分割基础
目标=卷积神经网络 · 编码器-解码器结构 · U-Net及其变体
深度学习分割基础
目标=卷积神经网…
08
WSI语义分割实战
目标=使用U-Net进行肿瘤区域分割 · 数据增强 · 类别不平衡处理
WSI
语义分割实战
09
多类别组织分割
目标=上皮 · 间质 · 坏死
多类别组织分割
目标=上皮
10
细胞核分割与实例分割
目标=细胞核检测与分割 · Mask R-CNN · HoVer-Net
细胞核分割
实例分割
11
腺体分割与结构量化
目标=腺体形态学特征 · 腺体分割方法(U-Net++ · 多尺度)
腺体分割
结构量化
12
WSI分割中的多尺度与上下文建模
目标=金字塔池化 · 空洞卷积 · Transformer与自注意力
WSI
分割
13
弱监督与半监督WSI分割
目标=仅图像级标签 · 点标注 · 涂鸦标注
WSI
弱监督
14
WSI分割中的域适应与泛化
目标=不同中心 · 扫描仪 · 染色差异
WSI
分割
15
分割后处理与优化
目标=形态学后处理 · 连通域分析 · 条件随机场
分割后处理
优化
16
WSI定量分析基础
目标=形态学特征(面积 · 周长 · 圆度
WSI
定量分析基础
17
细胞核定量分析
目标=核密度 · 核面积 · 核形态
细胞核定量分析
目标=核密度
18
腺体与组织定量分析
目标=腺体面积比 · 腺体周长 · 间质比例
腺体
组织定量分析
19
WSI分割与分子标志物关联
目标=从形态预测分子分型 · MSI · EGFR
WSI
分割
20
WSI分割中的可视化与解释
目标=分割结果叠加 · 热力图 · 注意力图
WSI
分割
21
WSI分割模型训练技巧
目标=学习率调度 · 优化器选择 · 混合精度训练
WSI
分割模型训练技巧
22
WSI分割模型评估与验证
目标=交叉验证 · 留出法 · 评估指标(Dice
WSI
分割模型评估
23
WSI分割中的类别不平衡与难例挖掘
目标=重采样 · 加权损失 · Focal Loss
WSI
分割
24
WSI分割中的噪声与伪影处理
目标=组织折叠 · 气泡 · 笔迹
WSI
分割
25
WSI分割与定量分析流程集成
目标=从WSI读取到结果输出的完整p… · 模块化设计 · 配置文件管理
WSI
分割
26
WSI分割中的大图像推理优化
目标=滑动窗口推理 · 批处理 · GPU内存管理
WSI
分割
27
WSI分割结果存储与交换
目标=分割掩膜格式(PNG · TIFF · GeoJSON)
WSI
分割结果存储
28
WSI分割与定量分析的质量控制
目标=人工审核 · 一致性评估 · 标注者间变异
WSI
分割
29
WSI分割在临床与研究中的应用案例
目标=肿瘤分级 · 预后预测 · 免疫治疗响应
WSI
分割
30
WSI分割与定量分析前沿与挑战
目标=基础模型(UNI · Virchow) · 自监督学习
WSI
分割
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