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蛋白结晶与结构研究实验

共计 30 章节
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01
课程导入与实验安全
目标=蛋白结晶与结构研究的整体流程 · 实验室安全规范 · 常用仪器与耗材认知
课程导入实验安全
02
目标蛋白的获取与评估
目标=重组表达策略 · 亲和纯化 · 标签切除
目标蛋白的获取评估
03
蛋白样品的预处理与配方优化
目标=缓冲液选择 · 还原剂与螯合剂 · 去垢剂添加
蛋白样品的预处理配方优化
04
结晶热力学与动力学基础
目标=溶解度曲线 · 过饱和度 · 成核与生长机制
结晶热力学动力学基础
05
结晶筛选策略与试剂盒使用
目标=商业筛选试剂盒选择 · 坐滴/悬滴/油滴/微批等常用方法操作…
结晶筛选策略试剂盒使用
06
初始结晶筛选实验
目标=96孔板设置 · 母液配制 · 液滴分配
初始结晶筛选实验目标=96孔板设…
07
结晶条件的优化
目标=pH · 沉淀剂 · 离子强度
结晶条件的优化pH
08
晶体的挑取、冷冻与数据收集准备
目标=防冻液选择 · 液氮冷冻 · 晶体安装
晶体的挑取冷冻
09
X射线衍射数据收集
目标=同步辐射与实验室光源 · 衍射图像采集策略 · 分辨率与完整度评估
X射线衍射数据收…目标=同步辐射
10
衍射数据处理
目标=索引 · 积分 · 缩放与合并
衍射数据处理目标=索引
11
相位问题与分子置换
目标=同源模型准备 · 旋转与平移搜索 · 分子置换成功与失败案例分析
相位问题分子置换
12
实验相位方法
目标=多对同晶置换 · 多波长异常散射 · 单波长异常散射的原理与实验设计
实验相位方法目标=多对同晶置…
13
电子密度图解析与模型搭建
目标=自动建模与手动搭建 · Coot操作 · 主链与侧链拟合
电子密度图解析模型搭建
14
结构精修与验证
目标=REFMAC · PHENIX精修策略 · 立体化学限制
结构精修验证
15
结构解析中的常见问题与解决
目标=各向异性 · 孪晶 · 无序
结构解析常见问题
16
蛋白-配体复合物结晶与结构研究
目标=共结晶 · 浸泡法 · 配体设计
蛋白配体复合物结晶
17
膜蛋白结晶与结构研究
目标=去垢剂筛选 · 脂立方相 · 抗体片段辅助结晶
膜蛋白结晶结构研究
18
蛋白质-蛋白质复合物结晶
目标=复合物组装 · 交联 · 稳定化
蛋白质蛋白质复合物结晶
19
晶体学在药物设计中的应用
目标=基于结构的药物设计 · 片段筛选 · 先导化合物优化
晶体学药物设计
20
冷冻电镜与晶体学的互补
目标=样品制备 · 数据收集 · 与X射线晶体学的比较与联合使用
冷冻电镜晶体学的互补
21
小角X射线散射在溶液结构研究中的应用
目标=样品要求 · 数据采集 · 建模与晶体学验证
小角X射线散射溶液结构研究
22
晶体学数据与结构 deposition
目标=PDB提交 · 数据格式 · 验证报告
deposition晶体学数据
23
蛋白结晶实验记录与可重复性
目标=电子实验记录 · 条件数据库 · 统计分析
蛋白结晶实验记录可重复性
24
自动化与高通量结晶
目标=液体处理机器人 · 成像系统 · 机器学习预测结晶条件
自动化高通量结晶
25
微晶与串行飞秒晶体学
目标=微晶制备 · 注射器与固定靶 · XFEL数据收集与处理
微晶串行飞秒晶体学
26
时间分辨晶体学与动态结构研究
目标=泵浦-探针实验 · 反应中间体捕获 · 数据解析
时间分辨晶体学动态结构研究
27
蛋白结构研究中的互补技术
目标=圆二色 · 荧光 · ITC
蛋白结构研究互补技术
28
案例研究一
目标=激酶结构解析与抑制剂复合物——…
案例研究一目标=激酶结构解…
29
案例研究二
目标=多结构域蛋白的结晶与相位解析—…
案例研究二目标=多结构域蛋…
30
课程总结与前沿展望
目标=蛋白结晶与结构研究的未来方向 · 人工智能与自动化趋势 · 职业发展路径
课程总结前沿展望